RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 INSL3P51460 131 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ORMDL3Q8N138 153 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ARPC1AQ92747 370 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 IGKV1-17P01599 117 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SMIM13P0DJ93 91 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 EVI2AP22794 236 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 U3KQK5 164 aa7.12□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 TEX22C9J3V5 150 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SH2D1AO60880 128 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 Q8TAT8 98 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 H3BMG7 143 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SIVA1O15304 175 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 PLA2G2AP14555 144 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 CKS2P33552 79 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ATP5G2Q06055 141 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ODF1Q14990 250 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ZNF575Q86XF7 245 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 CCL19Q99731 98 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 VGLL1Q99990 258 aa7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ATP5J2P56134 94 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ETDBQ3ZM63 59 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 DTX2Q86UW9 622 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 FBXL15Q9H469 300 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 A0A1B0GV72 72 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 TMEM189A5PLL7 270 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 TWIST1Q15672 202 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SIGMAR1Q99720 223 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.1□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 I3L2K1 104 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 LEPP41159 167 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 ITPR3Q14573 2671 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 IL4P05112 153 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 HLA-DMBP28068 263 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 RNF185Q96GF1 192 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 FOXC2Q99958 501 aa7.09□□□□□ -1.27
THBS3-211ENST00000541990 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 H3BRN7 92 aa7.08□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 CRYGBP07316 175 aa7.08□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 CT45A10P0DMU9 189 aa7.08□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 DLX6P56179 175 aa7.08□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.08□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 AGRNO00468 2067 aa7.08□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.08□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.08□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 IGLL5B9A064 214 aa7.08□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TIMD4Q96H15 378 aa7.08□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.08□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.07□□□□□ -1.28
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THBS3-211ENST00000541990 K7EIM0 57 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 PRSS1P07477 247 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 EFNA4P52798 201 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 E9PLD3 99 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 RAB9AP51151 201 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 CEND1Q8N111 149 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 ATP6V0BQ99437 205 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 COX6B1P14854 86 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 Q6AWC8 147 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 RNF125Q96EQ8 232 aa7.07□□□□□ -1.28
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