RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.42□□□□□ -1.22
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PTPRB-204ENST00000538708 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-204ENST00000538708 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-204ENST00000538708 INSL3P51460 131 aa7.42□□□□□ -1.22
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PTPRB-204ENST00000538708 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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PTPRB-204ENST00000538708 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-204ENST00000538708 POU2AF1Q16633 256 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-204ENST00000538708 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-204ENST00000538708 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-204ENST00000538708 I3L2K1 104 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-204ENST00000538708 IGHG2P01859 326 aa7.36□□□□□ -1.23
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