RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524318.3

SFTPC-211, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

TSL 3

Gene SFTPC, Length 993 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-211ENST00000524318 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 RBAKDNA6NC62 111 aa7.19□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 SLAQ13239 276 aa7.19□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.19□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 ATP5SQ99766 215 aa7.19□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 PRO0255Q9UI72 69 aa7.19□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.19□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.19□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 SIVA1O15304 175 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 MPC2O95563 127 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 IFNA5P01569 189 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 CRYBA4P53673 196 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF415Q09FC8 603 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 FHL2Q14192 279 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF266Q14584 549 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 MUC21Q5SSG8 566 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 C8orf49Q96NF6 230 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 MDFICQ9P1T7 246 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 HSPB11Q9Y547 144 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 DIRC3C9JPN6 131 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 SSNA1O43805 119 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 NXPH4O95158 308 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 PET100P0DJ07 73 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 LINC00315P59091 139 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 TAS2R45P59539 299 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 KRTAP10-2P60368 255 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 KHDC3LQ587J8 217 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 HYLS1Q96M11 299 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.17□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.16□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 Q6AWC8 147 aa7.16□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.16□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 SPXQ9BT56 116 aa7.16□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 MBD2Q9UBB5 411 aa7.16□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 PGPA6NDG6 321 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 A6NHS1 94 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 SFTA3P0C7M3 94 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 DEFA1P59665 94 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 DEFA3P59666 94 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 TMED6Q8WW62 240 aa7.15□□□□□ -1.26
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SFTPC-211ENST00000524318 ZNF479Q96JC4 524 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 OTORQ9NRC9 128 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTPC-211ENST00000524318 A0A1W2PPV4 95 aa7.14□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 GNRH2O43555 120 aa7.14□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.14□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 Q8N1X5 172 aa7.14□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.14□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 WFDC1Q9HC57 220 aa7.14□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 NAGKQ9UJ70 344 aa7.14□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.14□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 HSPG2P98160 4391 aa7.13□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.13□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 K7EQD1 137 aa7.13□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 GYPEP15421 78 aa7.13□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 SRIP30626 198 aa7.13□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 TDRG1Q3Y452 100 aa7.13□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.13□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.13□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.13□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.13□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 M0R2P5 195 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 EREGO14944 169 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 ORM1P02763 201 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 RAB2AP61019 212 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 NFE4Q86UQ8 179 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 TVP23CQ96ET8 276 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 TREM1Q9NP99 234 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTPC-211ENST00000524318 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.11□□□□□ -1.27
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