RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	NPC2	P61916	151 aa		6.37	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		6.37	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		6.37	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		6.37	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		6.37	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	SYNJ2BP	P57105	145 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	TEX29	Q8N6K0	151 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	COPS9	Q8WXC6	57 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	SIGMAR1	Q99720	223 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193		P0C879	139 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	MTURN	Q8N3F0	131 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	FAM223B	A6NKX1	122 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193		A8MWV9	139 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	SPRY2	O43597	315 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	COX8A	P10176	69 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	DTX2	Q86UW9	622 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	CST9L	Q9H4G1	147 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	ERG28	Q9UKR5	140 aa		6.36	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	KNCN	A6PVL3	124 aa		6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	SCGB1A1	P11684	91 aa		6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	ESD	P10768	282 aa		6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF747	Q9BV97	191 aa		6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	DKK2	Q9UBU2	259 aa		6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193		K7EIM0	57 aa		6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	GP9	P14770	177 aa		6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-53	P01767	116 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193		Q8N8P6	123 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV1-69	P01742	117 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	HTN3	P15516	51 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	PAX2	Q02962	417 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	NCKAP5	O14513	1909 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01549	A6NIU2	74 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB131A	P59861	70 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193		Q5PR19	223 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193	SPX	Q9BT56	116 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NEK1-208	ENST00000512193		I3L2K1	104 aa		6.34	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		6.34	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		6.34	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		6.34	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		6.34	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TSPAN13	O95857	204 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A16	P16260	332 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	GTSF1	Q8WW33	167 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	HCFC1	P51610	2035 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193		F6UB75	175 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	MSMB	P08118	114 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	ETDB	Q3ZM63	59 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF503	Q96F45	646 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM238	C9JI98	176 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	PCP2	Q8IVA1	136 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf118	A6NHY6	69 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	FOXE3	Q13461	319 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	CR1L	Q2VPA4	569 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf159	Q96HA4	380 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	CGB3	P0DN86	165 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	CGB7	P0DN87	165 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	GAGE1	Q13065	139 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NEK1-208	ENST00000512193	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		6.32	□□□□□ -1.4

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