RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 K7EMT4 169 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 TCF15Q12870 199 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 PLPPR2Q96GM1 343 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 H7C423 109 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV4-39P01824 125 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 FAM223AQ8IWN6 122 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 ORMDL3Q8N138 153 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 U3KQK5 164 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 MYOFQ9NZM1 2061 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 GFRALQ6UXV0 394 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 SPAG17Q6Q759 2223 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM202A6NGA9 273 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV3-33P01772 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 CCKP06307 115 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 GP1BBP13224 206 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 RHOHQ15669 191 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 MSMPQ1L6U9 139 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 MKXQ8IYA7 352 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 EML6Q6ZMW3 1958 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF815PA8K554 130 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 FGF12P61328 243 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 DAD1P61803 113 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 FHL5Q5TD97 284 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 WDR86Q86TI4 376 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 D6R8Y8 96 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV1D-16P01601 117 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 FXYD7P58549 80 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 DCANP1Q8TF63 244 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 POLEQ07864 2286 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 Q1RN00 199 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 Q9H3A6 140 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 ALPK2Q86TB3 2170 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 LINC01546A6NGU7 62 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 M0R135 149 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 NDUFB3O43676 98 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 NGFP01138 241 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 COX6CP09669 75 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 XCL1P47992 114 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF576Q9H609 170 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 XCL2Q9UBD3 114 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00473A8K010 186 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 H7BZZ5 65 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZPA2 131 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 DAND5Q8N907 189 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 GRPP07492 148 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 PRR20EP86478 221 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 PRR20CP86479 221 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 PRR20DP86480 221 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 PRR20BP86481 221 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 PRR20AP86496 221 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC140Q96MF4 163 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 C8orf87E5RJ46 101 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 IGLV3-27P01718 113 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV3-30P01768 117 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 SPINT3P49223 89 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 C6orf223Q8N319 242 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 CACNA1DQ01668 2161 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 DOCK7Q96N67 2140 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 FAM223BA6NKX1 122 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 NDUFA3O95167 84 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-216ENST00000507116 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
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