RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	0.05	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	G0S2	P27469	103 aa		0.05	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	DNAJB13	P59910	316 aa		0.05	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		0.05	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		0.05	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	0.05	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	ANK1	P16157	1881 aa		0.05	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		0.05	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		0.05	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	HIGD1C	A8MV81	97 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	PPP5D1	E7EU14	171 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	PFDN1	O60925	122 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	STX12	Q86Y82	276 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	CCDC32	Q9BV29	185 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	NIN	Q8N4C6	2090 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	IGF2R	P11717	2491 aa		0.04	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	TMEM189	A5PLL7	270 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268		H3BMG7	143 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	CDC42EP2	O14613	210 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	TPST1	O60507	370 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	IGKC	P01834	107 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	IL7	P13232	177 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	LXN	Q9BS40	222 aa		0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
USP34-222	ENST00000498268	SYNM	O15061	1565 aa		0.02	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	USP54	Q70EL1	1684 aa		0.02	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268		E5RI56	91 aa		0.02	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	SLC25A4	P12235	298 aa		0.02	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	ETV6	P41212	452 aa		0.02	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	GNG10	P50151	68 aa		0.02	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	BLCAP	P62952	87 aa		0.02	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		0.02	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		0.02	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		0.02	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		0.02	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	ANK2	Q01484	3957 aa		0.02	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	PIEZO1	Q92508	2521 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	IFITM5	A6NNB3	132 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	IGF2	P01344	180 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	CRYGS	P22914	178 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	RHOH	Q15669	191 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	MORN4	Q8NDC4	146 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268		A0A0G2JMM0	328 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268		A0A1W2PRE2	83 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268		M0QZK8	103 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	FAM107A	O95990	144 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	CKS2	P33552	79 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	COL7A1	Q02388	2944 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	BRK1	Q8WUW1	75 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	DMAC1	Q96GE9	116 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	MED31	Q9Y3C7	131 aa		0	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	ROCK1	Q13464	1354 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268		E7EQ34	232 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	SPINK1	P00995	79 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	PROK2	Q9HC23	129 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
USP34-222	ENST00000498268	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		-0.01	□□□□□ -2.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.2 ms