RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489487.1

TMEM30CP-202, Transcript of transmembrane protein 30C, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM30CP, Length 380 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CP-202ENST00000489487 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-0.68□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 NF1P21359 2839 aa-0.68□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 POLQO75417 2590 aa-0.68□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-0.68□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 HERC1Q15751 4861 aa-0.69□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 CSN2P05814 226 aa-0.69□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 BORCS8Q96FH0 119 aa-0.69□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 MYCBP2O75592 4640 aa-0.69□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 CACNA1HO95180 2353 aa-0.69□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 USP54Q70EL1 1684 aa-0.69□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 ANK1P16157 1881 aa-0.69□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 NCOR1O75376 2440 aa-0.7□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 IFNA1P01562 189 aa-0.7□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 TPT1P13693 172 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 DNAJB13P59910 316 aa-0.7□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 KLKP1Q107X0 134 aa-0.7□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.7□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 OR5H6Q8NGV6 325 aa-0.7□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 TAF9BQ9HBM6 251 aa-0.7□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-0.7□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 HERC2O95714 4834 aa-0.7□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 FGD6Q6ZV73 1430 aa-0.71□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 A0A096LNT2 108 aa-0.71□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa-0.71□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 FABP2P12104 132 aa-0.71□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 CCSMST1Q4G0I0 132 aa-0.71□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 BIN3Q9NQY0 253 aa-0.71□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 OTORQ9NRC9 128 aa-0.71□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 IL20Q9NYY1 176 aa-0.71□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 NEBP20929 6669 aa-0.71□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa-0.72□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 F8P00451 2351 aa-0.72□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 ETV6P41212 452 aa-0.72□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 ARF6P62330 175 aa-0.72□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 OR8J3Q8NGG0 315 aa-0.72□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 TRPM7Q96QT4 1865 aa-0.72□□□□□ -2.52
TMEM30CP-202ENST00000489487 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.72□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 TMEM210A6NLX4 147 aa-0.73□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 TPST1O60507 370 aa-0.73□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 LTC4SQ16873 150 aa-0.73□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 Q5XG85 94 aa-0.73□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.73□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 C19orf12Q9NSK7 152 aa-0.73□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 COMMD3Q9UBI1 195 aa-0.73□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 FAT1Q14517 4588 aa-0.73□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.73□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 ZNF292O60281 2723 aa-0.73□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 LPAP08519 4548 aa-0.74□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 MPC1LP0DKB6 136 aa-0.74□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 MAXP61244 160 aa-0.74□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 COX6A2Q02221 97 aa-0.74□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 DMAC1Q96GE9 116 aa-0.74□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 PRELID3AQ96N28 172 aa-0.74□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 LRTM1Q9HBL6 345 aa-0.74□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 MPC1Q9Y5U8 109 aa-0.74□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.74□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 MFSD11O43934 449 aa-0.75□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 BCL2P10415 239 aa-0.75□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 MED11Q9P086 117 aa-0.75□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-0.75□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.76□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 CHD9Q3L8U1 2897 aa-0.76□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-0.76□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 MCRIP1C9JLW8 97 aa-0.76□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 RPL19P84098 196 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 LYPD5Q6UWN5 251 aa-0.76□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 IDO2Q6ZQW0 420 aa-0.76□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 DSCR8Q96T75 97 aa-0.76□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-0.76□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 DLC1Q96QB1 1528 aa-0.76□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 UNC13BO14795 1591 aa-0.76□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.77□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 RREB1Q92766 1687 aa-0.77□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 TMEM189A5PLL7 270 aa-0.77□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 IFITM5A6NNB3 132 aa-0.77□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 C10orf142B7Z368 130 aa-0.77□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 CARD19Q96LW7 228 aa-0.77□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.77□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 JMJD1CQ15652 2540 aa-0.78□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 A0A0G2JMM0 328 aa-0.78□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-0.78□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 IGKCP01834 107 aa-0.78□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 IL7P13232 177 aa-0.78□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 GNG3P63215 75 aa-0.78□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.78□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 ATG5Q9H1Y0 275 aa-0.78□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 FKBP11Q9NYL4 201 aa-0.78□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 COL6A3P12111 3177 aa-0.78□□□□□ -2.53
TMEM30CP-202ENST00000489487 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.79□□□□□ -2.54
TMEM30CP-202ENST00000489487 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
TMEM30CP-202ENST00000489487 TECPR2O15040 1411 aa-0.79□□□□□ -2.54
TMEM30CP-202ENST00000489487 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
TMEM30CP-202ENST00000489487 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms