RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 RD3LP0DJH9 198 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 PYYP10082 97 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 NPPCP23582 126 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 CCL18P55774 89 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 TAS2R45P59539 299 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 RPL11P62913 178 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 BTN1A1Q13410 526 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 CST9LP1Q5W188 147 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 STXBP6Q8NFX7 210 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 OR51G1Q8NGK1 321 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 SUN5Q8TC36 379 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 FXYD5Q96DB9 178 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 RNF125Q96EQ8 232 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 TXN2Q99757 166 aa4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 H3BQ15 152 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 M0R036 132 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 NUDT3O95989 172 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 IL4P05112 153 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 FABP1P07148 127 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 AKR1C3P42330 323 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 DAD1P61803 113 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 HAMPP81172 84 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 TTC32Q5I0X7 151 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 Q8WTZ3 238 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 PAXXQ9BUH6 204 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 OR51M1Q9H341 326 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 HIGD1AQ9Y241 93 aa4.98□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 SCO2A0A1W2PP80 73 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF727A8MUV8 499 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 GGTLC3B5MD39 225 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 F6UZH7 168 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM250H0YL14 139 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 H3BRN7 92 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 H3BTX0 84 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 LINC00315P59091 139 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 PSMG4Q5JS54 123 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 TVP23CQ96ET8 276 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 UPK3BQ9BT76 320 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 DERL1Q9BUN8 251 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 PARLQ9H300 379 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.97□□□□□ -1.61
CASQ1-203ENST00000481081 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 A0A1W2PRE2 83 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 A0A1W2PS18 150 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 HELTA6NFD8 242 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 PDE6DO43924 150 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 NDUFB4O95168 129 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 HLA-DRB4P13762 266 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 CRYBB3P26998 211 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF600Q6ZNG1 722 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 TXNDC17Q9BRA2 123 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF586Q9NXT0 402 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 NAT8Q9UHE5 227 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.96□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF98A6NK75 572 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 SCGB2A1O75556 95 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 NBEAP1P0C6P0 100 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 FXYD7P58549 80 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 RANP62826 216 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 RHEBQ15382 184 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 BLNKQ8WV28 456 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 C11orf52Q96A22 123 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 U3KQE9 123 aa4.95□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 LYRM9A8MSI8 78 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 F5H768 121 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 IGLC2P0DOY2 106 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms