RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 PEMTQ9UBM1 199 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 ATRXP46100 2492 aa6.76□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 GAGE12BA1L429 117 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 C9orf118A6NHY6 69 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 FXYD7P58549 80 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 NDPQ00604 133 aa6.75□□□□□ -1.33
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PKP4-210ENST00000480171 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 NMUP48645 174 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 EBI3Q14213 229 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.75□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 Q8N6K4 173 aa6.75□□□□□ -1.33
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PKP4-210ENST00000480171 FCER1GP30273 86 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 CNFNQ9BYD5 112 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 RBAKDNA6NC62 111 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 HLA-DMBP28068 263 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 LINC01546A6NGU7 62 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 CCL21O00585 134 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 LEPP41159 167 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 FOXE3Q13461 319 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 KIR3DS1Q14943 382 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 PIFOQ8TCI5 191 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 RNF185Q96GF1 192 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 SPTA1P02549 2419 aa6.74□□□□□ -1.33
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PKP4-210ENST00000480171 K7ENP7 123 aa6.73□□□□□ -1.33
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PKP4-210ENST00000480171 PRSS1P07477 247 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 TCTAP57738 103 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 ERCC8Q13216 396 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 C18orf15Q96N68 181 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.73□□□□□ -1.33
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PKP4-210ENST00000480171 A0A0G2JLM5 398 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 H3BUT2 72 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 ATP5LO75964 103 aa6.73□□□□□ -1.33
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PKP4-210ENST00000480171 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 MALP21145 153 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 C15orf32Q32M92 178 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 PTH2Q96A98 100 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 K7EP34 96 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 PCP2Q8IVA1 136 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 Q8N8P6 123 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 Q8N9W7 124 aa6.72□□□□□ -1.33
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PKP4-210ENST00000480171 IGKCP01834 107 aa6.71□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 SMIM13P0DJ93 91 aa6.71□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 ECSCRQ19T08 205 aa6.71□□□□□ -1.33
PKP4-210ENST00000480171 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.71□□□□□ -1.33
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PKP4-210ENST00000480171 HIGD1BQ9P298 99 aa6.71□□□□□ -1.33
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PKP4-210ENST00000480171 EVI2AP22794 236 aa6.71□□□□□ -1.34
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PKP4-210ENST00000480171 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.71□□□□□ -1.34
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PKP4-210ENST00000480171 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 DPM2O94777 84 aa6.7□□□□□ -1.34
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PKP4-210ENST00000480171 METTL26Q96S19 204 aa6.7□□□□□ -1.34
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PKP4-210ENST00000480171 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.69□□□□□ -1.34
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PKP4-210ENST00000480171 GCSHP23434 173 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 NBL1P41271 181 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 ATP6V0E1O15342 81 aa6.69□□□□□ -1.34
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