RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM18	Q96B42	140 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	ITPR2	Q14571	2701 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1B0GW15	77 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	LY6G6D	O95868	133 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	DCANP1	Q8TF63	244 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	PEMT	Q9UBM1	199 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	AMBP	P02760	352 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	HILS1	P60008	231 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC01559	Q495D7	138 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230		F6UB75	175 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	DEFB1	P60022	68 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	JMJD8	Q96S16	334 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	PAFAH1B2	P68402	229 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	SERF1A	O75920	110 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230		J3KRW8	73 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230		K7EQG2	157 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF688	P0C7X2	276 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	SST	P61278	116 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	PSMG4	Q5JS54	123 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230		F2Z2F3	143 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	NUPR1	O60356	82 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLC6	P0CF74	106 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1W2PRX2	142 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	GPX1	P07203	203 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	CD28	P10747	220 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	CTRL	P40313	264 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	GATD1	Q8NB37	220 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	ESD	P10768	282 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	PRR9	Q5T870	116 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	TWIST1	Q15672	202 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	MUC21	Q5SSG8	566 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	ACAN	P16112	2415 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00310	P59036	64 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	PYY3	Q5JQD4	70 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	NIT2	Q9NQR4	276 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	NAGK	Q9UJ70	344 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	CD33	P20138	364 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	KCNS1	Q96KK3	526 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	NDUFA7	O95182	113 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	CSN3	P07498	182 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	NTF3	P20783	257 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF575	Q86XF7	245 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	CCL24	O00175	119 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A0J9YX75	114 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	LEP	P41159	167 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZQT7	251 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCFC2-208	ENST00000472230	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	INAFM1	C9JVW0	142 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	PMCH	P20382	165 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	ODF3	Q96PU9	254 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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