RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 FAM96AQ9H5X1 160 aa-1.51□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 NPVFQ9HCQ7 196 aa-1.51□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 TREM1Q9NP99 234 aa-1.51□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 BATF3Q9NR55 127 aa-1.51□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 CHRAC1Q9NRG0 131 aa-1.51□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 COA4Q9NYJ1 87 aa-1.51□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 KIF27Q86VH2 1401 aa-1.51□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-1.51□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 KIF1BO60333 1816 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 ZFHX3Q15911 3703 aa-1.52□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 BIRC5O15392 142 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 CST8O60676 142 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa-1.52□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 ANXA8P13928 327 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 SYT1P21579 422 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 SRP14P37108 136 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 AKR1D1P51857 326 aa-1.52□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 NPC2P61916 151 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 ANXA8L1Q5VT79 327 aa-1.52□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 SLC51BQ86UW2 128 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 C4orf33Q8N1A6 199 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 OR5AK3PQ8NH89 298 aa-1.52□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 BET1LQ9NYM9 111 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 PARP14Q460N5 1801 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 SBF2Q86WG5 1849 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 MYO9AB2RTY4 2548 aa-1.52□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa-1.53□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 BBIP1A8MTZ0 92 aa-1.53□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa-1.53□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 LRRN3E7EW58 273 aa-1.53□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 CRYZL1O95825 349 aa-1.53□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 CST4P01036 141 aa-1.53□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 CRHP06850 196 aa-1.53□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 MYH1P12882 1939 aa-1.53□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 DDTP30046 118 aa-1.53□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 RPL12P30050 165 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 MARCKSL1P49006 195 aa-1.53□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 C1orf140Q5VVS0 124 aa-1.53□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa-1.53□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 ATG5Q9H1Y0 275 aa-1.53□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa-1.53□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 ITPR2Q14571 2701 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 TAX1BP3O14907 124 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 RER1O15258 196 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 STX10O60499 249 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 STAG3L2P0CL84 134 aa-1.54□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 INSL3P51460 131 aa-1.54□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 PIGYQ3MUY2 71 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 LELP1Q5T871 98 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 DNM1P34Q6PK57 102 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 IZUMO2Q6UXV1 221 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 CD302Q8IX05 232 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 KRT222Q8N1A0 295 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 C20orf197Q8N268 126 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 C9orf62Q8N4C0 152 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 OR4S1Q8NGB4 309 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 GRPEL2Q8TAA5 225 aa-1.54□□□□□ -2.66
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