RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GW15 77 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PS18 150 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM213A2RRL7 107 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-11P01762 117 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 GPX1P07203 203 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 ELANEP08246 267 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 PF4V1P10720 104 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 SRIP30626 198 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 CSN1S1P47710 185 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 PAFAH1B2P68402 229 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 CYB5R2Q6BCY4 276 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 REC114Q7Z4M0 266 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 NIT1Q86X76 327 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 WFDC11Q8NEX6 87 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM18Q96B42 140 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 SMPXQ9UHP9 88 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 U3KQK5 164 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00587B1AMM8 73 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 LGALS9O00182 355 aa4.26□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 EDN2P20800 178 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF138P52744 262 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 IQCJQ1A5X6 159 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 TM4SF20Q53R12 229 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 PRR9Q5T870 116 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 IL17RELQ6ZVW7 336 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 DCANP1Q8TF63 244 aa4.26□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.26□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.25□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 A8MTW9 85 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 BMI1P35226 326 aa4.25□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 CTAG1AP78358 180 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 NRN1Q9NPD7 142 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 A0A087WW49 117 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa4.24□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 C2orf70A6NJV1 201 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 OVOL1O14753 267 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 SNAI2O43623 268 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 CD5LO43866 347 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 RIGQ13278 110 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 PRR31Q5SQ13 230 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.24□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 BAGE3Q86Y29 109 aa4.24□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 RNF185Q96GF1 192 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00477Q96M19 166 aa4.24□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 UFC1Q9Y3C8 167 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 MUC4Q99102 2169 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 A0A096LNJ9 63 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 KLLNB2CW77 178 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 K7EQG2 157 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 NXPH4O95158 308 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 OR5AL1P0C617 328 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB1P60022 68 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 PKIAP61925 76 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 FAM106AQ4KMX7 169 aa4.23□□□□□ -1.73
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