RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462323.5

MUC4-208, Transcript of mucin 4, cell surface associated, human

TSL 5

Gene MUC4, Length 16,197 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC4-208	ENST00000462323	STH	Q8IWL8	128 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	FXYD2	P54710	66 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	LEPROT	O15243	131 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF138	P52744	262 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	LINC00310	P59036	64 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	NPC2	P61916	151 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MUC4-208	ENST00000462323	IGHG4	P01861	327 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CD7	P09564	240 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323		V9GYV3	84 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	VCY	O14598	125 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	HTN3	P15516	51 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	MDS2	Q8NDY4	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	HAMP	P81172	84 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	RPRML	Q8N4K4	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TIRAP	P58753	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323		Q6ZQT7	251 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CRLF1	O75462	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	NBR2	O15453	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	MGAM	O43451	1857 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGHG3	P01860	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	AGRN	O00468	2067 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	POLQ	O75417	2590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	LCT	P09848	1927 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323		F8WEM9	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	HAX1	O00165	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TSC2	P49815	1807 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CD28	P10747	220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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