RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 FBXL15Q9H469 300 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 CHEK1O14757 476 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 ACTL6BO94805 426 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 MOSP00540 346 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 AVPP01185 164 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 CSN3P07498 182 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 HES1Q14469 280 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PRR31Q5SQ13 230 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 A0A1B0GXF2 115 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 E9PLD3 99 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 K7ERJ3 54 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 FXYD2P54710 66 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 XGP55808 180 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 TM2D2Q9BX73 214 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 VCX2Q9H322 139 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PRSS46E5RG02 174 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 NBR2O15453 112 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 NCR2O95944 276 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 IGHV1-69P01742 117 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PF4V1P10720 104 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 WT1-ASQ06250 92 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 IGLL5B9A064 214 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 NDUFA3O95167 84 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 EBI3Q14213 229 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PLGLAQ15195 96 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 Q6AWC8 147 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 AMTNQ6UX39 209 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 Q8N6K4 173 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 NPBQ8NG41 125 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 ACANP16112 2415 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 GGTLC3B5MD39 225 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 J3QLI3 93 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 CT45A10P0DMU9 189 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PCP2Q8IVA1 136 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PRELID3AQ96N28 172 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 SCGB2A1O75556 95 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 APELAP0DMC3 54 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 C2orf83Q53S99 150 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 C18orf15Q96N68 181 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 FAM106CPP0CH98 169 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 TEX22C9J3V5 150 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 LINC00479Q96M42 142 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 HIGD1BQ9P298 99 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 CACNG7P62955 275 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 TTC32Q5I0X7 151 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PSMG4Q5JS54 123 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PRO0461Q9UI25 63 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 AKAP9Q99996 3911 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 MLANAQ16655 118 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 CEND1Q8N111 149 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 PIFOQ8TCI5 191 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 GLMPQ8WWB7 406 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-210ENST00000453727 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
LMO3-210ENST00000453727 TMEM262E9PQX1 116 aa6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms