RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 RAB19A4D1S5 217 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 PGPA6NDG6 321 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 ZNF253O75346 499 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 PEA15Q15121 130 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 NDUFA5Q16718 116 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 C12orf74Q32Q52 190 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 RNF212Q495C1 297 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 OTORQ9NRC9 128 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 INSP01308 110 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 GNG5P63218 68 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 NEU1Q99519 415 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 PRAC2D3DTV9 90 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 J3KRW8 73 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 M0R3E3 92 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 CEBPGP53567 150 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 AMTNQ6UX39 209 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 CELA1Q9UNI1 258 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 PKD1P98161 4303 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 C9JQL5 133 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 F6UZH7 168 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 CSN1S1P47710 185 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 UQCC3Q6UW78 93 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 PRELID1Q9Y255 219 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 PEX7O00628 323 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 PDE6DO43924 150 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 HTN1P15515 57 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 AKR1C3P42330 323 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 RRN3P1Q2M238 152 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZR54 194 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 EPDR1Q9UM22 224 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 A8MTW9 85 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 DIRC3C9JPN6 131 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 CDK2AP2O75956 126 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 TCRAP04437 139 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 C11orf52Q96A22 123 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 LINC01587Q99440 93 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 ATG101Q9BSB4 218 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 C16orf90A8MZG2 172 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 TMEM250H0YL14 139 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 PRM2P04554 102 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 SFTA3P0C7M3 94 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 CDKN1BP46527 198 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 ERCC8Q13216 396 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 ZNF575Q86XF7 245 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 SGK494Q96LW2 274 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 PARLQ9H300 379 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 K7EQM0 130 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 TSPOP30536 169 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 LEPP41159 167 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 UBE2G1P62253 170 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 LINC00479Q96M42 142 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 DERL1Q9BUN8 251 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 HSPG2P98160 4391 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-210ENST00000442481 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms