RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa15.04■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 X6R8D5 127 aa15.04■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15.03■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 CXorf65A6NEN9 183 aa15.03■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 KLLNB2CW77 178 aa15.03■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 GPX1P07203 203 aa15.03■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM183BQ1AE95 376 aa15.03■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 Q86TA4 180 aa15.03■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.03■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 TREM1Q9NP99 234 aa15.03■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 KLF12Q9Y4X4 402 aa15.03■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa15.02■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 C7orf71A4D174 169 aa15.02■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa15.02■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 GFI1BQ5VTD9 330 aa15.02■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 C20orf144Q9BQM9 153 aa15.02■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 MED9Q9NWA0 146 aa15.02■□□□□ -0
C4orf48-201ENST00000409248 SMIM9A6NGZ8 99 aa15.01□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 RGS13O14921 159 aa15.01□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 DEFB4AO15263 64 aa15.01□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 KIR3DS1Q14943 382 aa15.01□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 NEU1Q99519 415 aa15.01□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM208Q9BTX3 173 aa15.01□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 NUPR2A6NF83 97 aa15□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 BTN1A1Q13410 526 aa15□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM256Q8N2U0 113 aa15□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 C11orf45Q8TAV5 145 aa15□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 TVP23CQ96ET8 276 aa15□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa15□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 ZFP30Q9Y2G7 519 aa15□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM250H0YL14 139 aa14.99□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.99□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 TAS2R60P59551 318 aa14.99□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 PRR9Q5T870 116 aa14.99□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.99□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.98□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 LTAP01374 205 aa14.98□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 PEA15Q15121 130 aa14.98□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 SMUG1Q53HV7 270 aa14.98□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 C8orf49Q96NF6 230 aa14.98□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 LINC01587Q99440 93 aa14.98□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM189A5PLL7 270 aa14.97□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 H7BYZ3 331 aa14.97□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 DERL1Q9BUN8 251 aa14.97□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 BAGE2Q86Y30 109 aa14.96□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.96□□□□□ -0.01
C4orf48-201ENST00000409248 GCGP01275 180 aa14.95□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 CEBPGP53567 150 aa14.95□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 RRN3P1Q2M238 152 aa14.95□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 Q6AWC8 147 aa14.95□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.95□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 TRAV21A0A0B4J279 112 aa14.94□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 GNG4P50150 75 aa14.94□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.94□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 CENPWQ5EE01 88 aa14.94□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.94□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 RAB19A4D1S5 217 aa14.93□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.93□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.93□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 PARLQ9H300 379 aa14.93□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.92□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.92□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 CSMD3Q7Z407 3707 aa14.92□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 HTN1P15515 57 aa14.91□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 SMIM12Q96EX1 92 aa14.91□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.91□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.91□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.9□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 C9JCJ5 164 aa14.9□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 EMP1P54849 157 aa14.9□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 Q6ZQT7 251 aa14.9□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 MLST8Q9BVC4 326 aa14.9□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 NAGKQ9UJ70 344 aa14.9□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 CELA1Q9UNI1 258 aa14.9□□□□□ -0.02
C4orf48-201ENST00000409248 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.89□□□□□ -0.03
C4orf48-201ENST00000409248 C9JQL5 133 aa14.89□□□□□ -0.03
C4orf48-201ENST00000409248 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.89□□□□□ -0.03
C4orf48-201ENST00000409248 MUC21Q5SSG8 566 aa14.89□□□□□ -0.03
C4orf48-201ENST00000409248 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.89□□□□□ -0.03
C4orf48-201ENST00000409248 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.89□□□□□ -0.03
C4orf48-201ENST00000409248 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
C4orf48-201ENST00000409248 SMIM7Q9BQ49 75 aa14.89□□□□□ -0.03
C4orf48-201ENST00000409248 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms