RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 CTRLP40313 264 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 S100A12P80511 92 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 KCNS1Q96KK3 526 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 DUX5Q96PT3 197 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 TPPP3Q9BW30 176 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 NIT2Q9NQR4 276 aa8.45□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 A0A087WW49 117 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 PYY3Q5JQD4 70 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.44□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 F2Z2F3 143 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 LINC01619G3V211 115 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 SYNJ2BPP57105 145 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 Q6ZSV7 163 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 C20orf173Q96LM9 149 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 PEMTQ9UBM1 199 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.43□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1B0GUS0 222 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 IGLC6P0CF74 106 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 DCANP1Q8TF63 244 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 DPF1Q92782 380 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 C2orf70A6NJV1 201 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 IQCJQ1A5X6 159 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 CNFNQ9BYD5 112 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 PDZD2O15018 2839 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 HSBP1O75506 76 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 GPX1P07203 203 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 AMTP48728 403 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 LINC00310P59036 64 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 JMJD8Q96S16 334 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-202ENST00000395322 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 NUPR1O60356 82 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 SRD5A1P18405 259 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 TWIST1Q15672 202 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 OR11H1Q8NG94 326 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 RCHY1Q96PM5 261 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 ODF3Q96PU9 254 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 K7EQG2 157 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 CACNG7P62955 275 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 C16orf95Q9H693 158 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 ESM1Q9NQ30 184 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 OR5AL1P0C617 328 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 RAB4AP20338 218 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 PMCHP20382 165 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 EDN2P20800 178 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 SLURP1P55000 103 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 HILS1P60008 231 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTXN3-202ENST00000395322 NTF3P20783 257 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms