RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 H3BMM0 161 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2WQ96B02 151 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 CD5LO43866 347 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 NPYP01303 97 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 ELANEP08246 267 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 RMI2Q96E14 147 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 IGLC1P0CG04 106 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 FXYD5Q96DB9 178 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFA12Q9UI09 145 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 FAM231BA6NCW3 169 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 APRG1Q8IVJ8 170 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 SPRY2O43597 315 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 VPREB3Q9UKI3 123 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 CCL24O00175 119 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 CFPP27918 469 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2V1Q13404 147 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 Q9HAA7 133 aa17.68■□□□□ 0.42
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PTPRM-201ENST00000332175 CRLF1O75462 422 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 PIP4P1Q86T03 277 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 CTSZQ9UBR2 303 aa17.67■□□□□ 0.42
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PTPRM-201ENST00000332175 IGHV2-70P01814 119 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 ARTNQ5T4W7 220 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 DYNAPQ8N1N2 210 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa17.64■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF124Q15973 351 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRM-201ENST00000332175 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
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PTPRM-201ENST00000332175 FOXI2Q6ZQN5 318 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF491Q8N8L2 437 aa17.63■□□□□ 0.41
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PTPRM-201ENST00000332175 DEFB113Q30KQ7 82 aa17.63■□□□□ 0.41
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PTPRM-201ENST00000332175 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa17.62■□□□□ 0.41
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PTPRM-201ENST00000332175 DOCK7Q96N67 2140 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRM-201ENST00000332175 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa17.6■□□□□ 0.41
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PTPRM-201ENST00000332175 TSC2P49815 1807 aa17.58■□□□□ 0.41
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PTPRM-201ENST00000332175 OR11H6Q8NGC7 330 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-201ENST00000332175 SLX1AQ9BQ83 275 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-201ENST00000332175 DKK2Q9UBU2 259 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-201ENST00000332175 C11orf53Q8IXP5 236 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-201ENST00000332175 K7EN84 100 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-201ENST00000332175 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-201ENST00000332175 J3QQQ9 107 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFS5O43920 106 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRM-201ENST00000332175 INAFM2P0DMQ5 153 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRM-201ENST00000332175 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
PTPRM-201ENST00000332175 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRM-201ENST00000332175 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRM-201ENST00000332175 CEND1Q8N111 149 aa17.55■□□□□ 0.4
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