RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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UBQLN3-201ENST00000311659 NBASA2RRP1 2371 aa6.57□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 IGLL5B9A064 214 aa6.57□□□□□ -1.36
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UBQLN3-201ENST00000311659 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
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UBQLN3-201ENST00000311659 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.56□□□□□ -1.36
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UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF479Q96JC4 524 aa6.55□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP6V0BQ99437 205 aa6.55□□□□□ -1.36
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UBQLN3-201ENST00000311659 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.55□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 PRO0461Q9UI25 63 aa6.55□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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UBQLN3-201ENST00000311659 TRGV3P03979 118 aa6.54□□□□□ -1.36
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UBQLN3-201ENST00000311659 H3BMG7 143 aa6.53□□□□□ -1.36
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UBQLN3-201ENST00000311659 LAGE3Q14657 143 aa6.53□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 CDSNQ15517 529 aa6.53□□□□□ -1.36
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UBQLN3-201ENST00000311659 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.53□□□□□ -1.36
UBQLN3-201ENST00000311659 RRN3P1Q2M238 152 aa6.52□□□□□ -1.36
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UBQLN3-201ENST00000311659 ETDBQ3ZM63 59 aa6.52□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.52□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.52□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 Q8N6K4 173 aa6.52□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.52□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.52□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 J3QR89 54 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 BUB3O43684 328 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 KLRD1Q13241 179 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 AMTNQ6UX39 209 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 RNF182Q8N6D2 247 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.51□□□□□ -1.37
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