RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299687.9

ZNF407-201, Transcript of zinc finger protein 407, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF407, Length 7,948 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407-201ENST00000299687 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 WFDC1Q9HC57 220 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 COL8A2P25067 703 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 K7ERS5 55 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.88□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 H3BQ85 93 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 C9orf118A6NHY6 69 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 PINLYPA6NC86 204 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 MPZP25189 248 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 EML5Q05BV3 1969 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 HLA-DMBP28068 263 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 UBE2AP49459 152 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 ATP6V0E1O15342 81 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 CD177Q8N6Q3 437 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 DSCAMO60469 2012 aa9.87□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 C8orf49Q96NF6 230 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 IGLL5B9A064 214 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 NDUFA4O00483 81 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 CRYGSP22914 178 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 TM2D2Q9BX73 214 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 CEND1Q8N111 149 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 NTF4P34130 210 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 ZNF134P52741 427 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 IL17DQ8TAD2 202 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 CASC2Q6XLA1 102 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 GGNQ86UU5 652 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 IGFBPL1Q8WX77 278 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 E7EQL1 145 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 Q6ZWC4 215 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 Q8N8P6 123 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 K7ENP7 123 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 PRSS46E5RG02 174 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 CFPP27918 469 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 Q86TA4 180 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 CCL24O00175 119 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 ETDBQ3ZM63 59 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 TECTAO75443 2155 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF407-201ENST00000299687 LY6HO94772 140 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 A0A0J9YY99 117 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 NREPQ16612 68 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 A0A1B0GUS0 222 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 TMEM213A2RRL7 107 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 Q6ZQT7 251 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 IGKV4-1P06312 121 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 PTPN13Q12923 2485 aa9.83□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 Q6ZS92 163 aa9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 LINC00479Q96M42 142 aa9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 REG4Q9BYZ8 158 aa9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 COX7B2Q8TF08 81 aa9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 TEX22C9J3V5 150 aa9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 H0Y9J4 135 aa9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 RNF183Q96D59 192 aa9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 SPATA25Q9BR10 227 aa9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 H3BMG7 143 aa9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 FGFBP3Q8TAT2 258 aa9.82□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.81□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 IGLV2-23P01705 113 aa9.81□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.81□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 A0A1B0GW64 132 aa9.81□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 H0YIZ8 118 aa9.81□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 NMSQ5H8A3 153 aa9.81□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 ACYP1P07311 99 aa9.81□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
ZNF407-201ENST00000299687 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms