RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.57□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.57□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 PRNTQ86SH4 94 aa9.57□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 Q86TA4 180 aa9.57□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 Q8NAQ8 132 aa9.57□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.57□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 TREM1Q9NP99 234 aa9.57□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2G1P62253 170 aa9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 IFITM2Q01629 132 aa9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 Q6AWC8 147 aa9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 FAM210AQ96ND0 272 aa9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.56□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 TAS2R60P59551 318 aa9.55□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.55□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 LINC01587Q99440 93 aa9.55□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.55□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.55□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.55□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.54□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 LTAP01374 205 aa9.54□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 RRN3P1Q2M238 152 aa9.54□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 TOR2AQ5JU69 321 aa9.54□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 C8orf49Q96NF6 230 aa9.54□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0J9YWU9 116 aa9.53□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM250H0YL14 139 aa9.53□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 RAB14P61106 215 aa9.53□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 SMUG1Q53HV7 270 aa9.53□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.52□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM189A5PLL7 270 aa9.52□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 GCGP01275 180 aa9.52□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 CLLU1Q5K131 121 aa9.52□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 Q6ZQT7 251 aa9.52□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.52□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 DERL1Q9BUN8 251 aa9.52□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 MED9Q9NWA0 146 aa9.52□□□□□ -0.88
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 C16orf74Q96GX8 76 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 MLST8Q9BVC4 326 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 RGS13O14921 159 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB4AO15263 64 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 PRM2P04554 102 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 AZU1P20160 251 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 TDRG1Q3Y452 100 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 BAGE2Q86Y30 109 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 SMIM12Q96EX1 92 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 HTN1P15515 57 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 CENPWQ5EE01 88 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.5□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 C9JCJ5 164 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 CRIP1P50238 77 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 MUC21Q5SSG8 566 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 PARLQ9H300 379 aa9.49□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 RAB19A4D1S5 217 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 CBY3A6NI87 242 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 IGLV2-8P01709 118 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 GNG4P50150 75 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 PEA15Q15121 130 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 KCNS1Q96KK3 526 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 DKK2Q9UBU2 259 aa9.48□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 IL17DQ8TAD2 202 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 NAGKQ9UJ70 344 aa9.47□□□□□ -0.89
CCDC42-201ENST00000293845 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms