RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 LCN15Q6UWW0 184 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP41-201ENST00000292729 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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USP41-201ENST00000292729 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.97□□□□□ -1.29
USP41-201ENST00000292729 PRSS46E5RG02 174 aa6.96□□□□□ -1.3
USP41-201ENST00000292729 SSSCA1O60232 199 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP41-201ENST00000292729 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
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USP41-201ENST00000292729 SEC11BP0C7V7 166 aa6.94□□□□□ -1.3
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USP41-201ENST00000292729 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
USP41-201ENST00000292729 SMCO3A2RU48 225 aa6.9□□□□□ -1.3
USP41-201ENST00000292729 KLLNB2CW77 178 aa6.9□□□□□ -1.3
USP41-201ENST00000292729 C9JCJ5 164 aa6.9□□□□□ -1.3
USP41-201ENST00000292729 TIRAPP58753 221 aa6.9□□□□□ -1.3
USP41-201ENST00000292729 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
USP41-201ENST00000292729 PATE2Q6UY27 113 aa6.9□□□□□ -1.3
USP41-201ENST00000292729 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.9□□□□□ -1.3
USP41-201ENST00000292729 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.9□□□□□ -1.3
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