RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 PRTN3P24158 256 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 EMP1P54849 157 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 MS4A6AQ9H2W1 248 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 CRXO43186 299 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 CD5LO43866 347 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 C2orf91Q6ZV80 131 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 A0A0G2JLM5 398 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 SAA4P35542 130 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 JKAMPQ9P055 326 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 PIEZO1Q92508 2521 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa10.4□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa10.4□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 LY6LH3BQJ8 138 aa10.4□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 NEGR1Q7Z3B1 354 aa10.4□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 F6UB75 175 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 DTX2Q86UW9 622 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 SPCS1Q9Y6A9 102 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 HTN1P15515 57 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 ARL3P36405 182 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 Q6AWC8 147 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 FLNCQ14315 2725 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 AGRNO00468 2067 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 F8W735 103 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 COTL1Q14019 142 aa10.38□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 LYPD1Q8N2G4 141 aa10.38□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.38□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 OR2K2Q8NGT1 345 aa10.38□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM8BA6NDV4 472 aa10.38□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.38□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa10.37□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 METTL26Q96S19 204 aa10.37□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 F5H697 171 aa10.37□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 SMIM17P0DL12 118 aa10.37□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 JMJD8Q96S16 334 aa10.37□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 K7ENP7 123 aa10.36□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 K7ERU9 68 aa10.36□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.36□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 C11orf21Q9P2W6 132 aa10.36□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 PF4V1P10720 104 aa10.36□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 RNF5Q99942 180 aa10.36□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1B0GW15 77 aa10.36□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 OR11H6Q8NGC7 330 aa10.36□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PPR1 153 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 FXYD2P54710 66 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 Q8N9W7 124 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 MSRB2Q9Y3D2 182 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 ZFHX3Q15911 3703 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 ADORA2A-AS1P86434 159 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 PDE6HQ13956 83 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 AMTNQ6UX39 209 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF502Q8TBZ5 544 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 HIST1H4GQ99525 98 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 TGFAP01135 160 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV12-3P01733 135 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 FABP2P12104 132 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 IGKCP01834 107 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 TTC9CQ8N5M4 171 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 ZANQ9Y493 2812 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 IGHG4P01861 327 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 SMIM13P0DJ93 91 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 ATP5G2Q06055 141 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 IGF2-ASQ6U949 168 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 NPBQ8NG41 125 aa10.34□□□□□ -0.75
TMOD1-201ENST00000259365 BUB3O43684 328 aa10.33□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 SAMD5Q5TGI4 173 aa10.33□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa10.33□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 LGALS9BQ3B8N2 356 aa10.33□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 LGALS9CQ6DKI2 356 aa10.33□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 NAV2Q8IVL1 2488 aa10.33□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 ITPR1Q14643 2758 aa10.33□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 SEC11AP67812 179 aa10.33□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 HSD52Q0P140 79 aa10.33□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.33□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa10.32□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 C9orf118A6NHY6 69 aa10.32□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 LY6G5BQ8NDX9 201 aa10.32□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 RNF185Q96GF1 192 aa10.32□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 CHAC1Q9BUX1 264 aa10.32□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 CYSLTR1Q9Y271 337 aa10.32□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 CELSR2Q9HCU4 2923 aa10.32□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 OVOL3O00110 214 aa10.32□□□□□ -0.76
TMOD1-201ENST00000259365 GNRH2O43555 120 aa10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms