RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223423.8

PTGS1-201, Transcript of prostaglandin-endoperoxide synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGS1, Length 2,328 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1-201ENST00000223423 FAM209BQ5JX69 171 aa9.52□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.52□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.52□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.52□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.52□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.52□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 PMCHL1Q16048 86 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 Q6YL49 198 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 LINC01559Q495D7 138 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.51□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.5□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 DEFB1P60022 68 aa9.5□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 Q6ZQT7 251 aa9.5□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF738Q8NE65 137 aa9.5□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.5□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 LINC00614P0C842 121 aa9.5□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 REC114Q7Z4M0 266 aa9.5□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 AMN1Q8IY45 258 aa9.5□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 CSN3P07498 182 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 TWIST1Q15672 202 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 C2orf70A6NJV1 201 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 FOXE3Q13461 319 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 PRR9Q5T870 116 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF702PQ9H963 129 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 SMPXQ9UHP9 88 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.49□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 CUBNO60494 3623 aa9.48□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 TMEM89A2RUT3 159 aa9.48□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 D6R8Y8 96 aa9.48□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 SRD5A1P18405 259 aa9.48□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.48□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.48□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 VAMP8Q9BV40 100 aa9.48□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 CNFNQ9BYD5 112 aa9.48□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 U3KQK5 164 aa9.48□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 K7EMT4 169 aa9.47□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9.47□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.47□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 F6UB75 175 aa9.47□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.47□□□□□ -0.89
PTGS1-201ENST00000223423 OVOL1O14753 267 aa9.46□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.46□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 LINC00477Q96M19 166 aa9.46□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 DUX5Q96PT3 197 aa9.46□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.46□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 SMKR1H3BMG3 65 aa9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 J3KRW8 73 aa9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 ATOH7Q8N100 152 aa9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 PRELID3AQ96N28 172 aa9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 CREBBPQ92793 2442 aa9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 ORMDL3Q8N138 153 aa9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 RNF185Q96GF1 192 aa9.45□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 SMR3AQ99954 134 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 HIVEP1P15822 2718 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 LEPROTL1O95214 131 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 NCR2O95944 276 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 DCANP1Q8TF63 244 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.44□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 GAS8-AS1O95177 125 aa9.43□□□□□ -0.9
PTGS1-201ENST00000223423 ELANEP08246 267 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms