RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Aqp11Q8BHH1 271 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cma2Q91VB1 246 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 9330161L09RikQ9D253 136 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 EppinQ9DA01 134 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmprss5Q9ER04 455 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BlnkQ9QUN3 457 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1224-ps1A3KGY4 311 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc16a4Q8R0M8 500 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 9930021J03RikH3BKP8 2027 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CrxO54751 299 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Emp2O88662 172 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Il2raP01590 268 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpr183Q3U6B2 357 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rasl11aQ6IMB1 242 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam53bQ8BGR5 422 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rbm14Q8C2Q3 669 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trpt1Q8K3A2 249 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr593Q8VF28 327 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1195Q8VG21 308 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Errfi1Q99JZ7 461 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 G6pcP35576 357 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cops9Q3U898 57 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc17a2Q5SZA1 478 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ClmQ7TSN2 230 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr559Q8VH14 318 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prr15Q9D1T5 122 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm44973A0A140LJJ1 189 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TymsP07607 307 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cited1P97769 203 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hcfc1r1Q9CYQ5 120 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cyb5r3Q9DCN2 301 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ntn3Q9R1A3 580 aa9.24□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm45844A0A1B0GRQ2 137 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fndc10A2A9Q0 223 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm21882J3QN86 361 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cd46O88174 365 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10118Q8C8J5 116 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc16a13Q8CE94 428 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bles03Q8VD62 251 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SnrpeP62305 92 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AgerQ62151 402 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf2Q8BIQ3 427 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1295Q8VF48 312 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Atp5lQ9CPQ8 103 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Alkbh7Q9D6Z0 221 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccl28Q9JIL2 130 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ssty1P13675 232 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PgpQ8CHP8 321 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sp5Q9JHX2 398 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm21731A0A286YDE9 180 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BsgP18572 389 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Il19Q8CJ70 176 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fbxo25Q9D2Y6 357 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4930447A16RikQ9D5F6 132 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 RetnlaQ9EP95 111 aa9.23□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv1-34A0A075B5V2 117 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp648D3Z0W3 525 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Irf2bp2E9Q1P8 570 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm614Q3V2K1 191 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm4792Q569Q2 183 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr702Q920Z2 318 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ndufaf3Q9JKL4 185 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spta1P08032 2415 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Igkv6-23A0A140T8N5 115 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm20219A0A1B0GRQ3 87 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SelenopP70274 380 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Srrm4Q8BKA3 608 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10283Q8C3L5 117 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr101Q920Z0 308 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dph7Q9CYU6 477 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Igkv9-124A0A0G2JDR3 117 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm5741B2RVA4 72 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Stac2Q8R1B0 408 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm2026A2ART4 498 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rnd3P61588 244 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trdv2-2Q5R1A4 116 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ypel2Q65Z95 119 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pgam5Q8BX10 288 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Aurkaip1Q9DCJ7 200 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ypel1Q9ESC7 118 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hoxa6P09092 232 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gstp2P46425 210 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dram1Q9DC58 238 aa9.22□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccr6O54689 367 aa9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ren2P00796 401 aa9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CortP56469 109 aa9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rps11P62281 158 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rgp1Q8BHT7 391 aa9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pard6aQ9Z101 346 aa9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trbv15A0A0A6YYE3 115 aa9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P01655 112 aa9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SellP18337 372 aa9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ifi27Q8C6G0 260 aa9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rnase2aQ8K196 155 aa9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Parm1Q923D3 296 aa9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lypd8Q9D7S0 255 aa9.21□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm15293D3YX02 93 aa9.21□□□□□ -0.94
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pax8Q00288 457 aa9.21□□□□□ -0.94
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1259Q8VEZ1 309 aa9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.4 ms