RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	RP1	P56715	2156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	LGALS9	O00182	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	ATOX1	O00244	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	UPK2	O00526	184 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	CXCL5	P42830	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	RIG	Q13278	110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	DEFB134	Q4QY38	66 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	MGAM	O43451	1857 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	PEX7	O00628	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	PRY	O14603	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TREML4	Q6UXN2	200 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TRGV9	Q99603	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	PI4KA	P42356	2102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		K7EM74	188 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A1B0GXF2	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	C4orf51	C9J302	202 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TIMM17B	O60830	172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6ZS49	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	UBE2L6	O14933	153 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	MKX	Q8IYA7	352 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	GP1BB	P13224	206 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	GYPE	P15421	78 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	FOXS1	O43638	330 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		P0DMU3	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	PRR25	Q96S07	402 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	MYCNOS	P40205	109 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	EFNA4	P52798	201 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	OBSL1	O75147	1896 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	ERCC8	Q13216	396 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	EBI3	Q14213	229 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6P435	159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A1B0GUT8	65 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	SI	P14410	1827 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	NDUFA3	O95167	84 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072		Q9H3A6	140 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	CCL8	P80075	99 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NECAP1-222	ENST00000640072	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms