RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.68□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBFOX3A6NFN3 312 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CT45A10P0DMU9 189 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBE2G1P62253 170 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRNTQ86SH4 94 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CSTL1Q9H114 145 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VAX2Q9UIW0 290 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A8MZ25 164 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 F6UZH7 168 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF138P52744 262 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AMTNQ6UX39 209 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SBSPONQ8IVN8 264 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC28AQ8IWP9 274 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LYPD6BQ8NI32 183 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBAKDNA6NC62 111 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LEPP41159 167 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIR3DS1Q14943 382 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HIST1H2BAQ96A08 127 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM210AQ96ND0 272 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A8MTW9 85 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BTN1A1Q13410 526 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF506Q5JVG8 444 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLLU1Q5K131 121 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 Q86TA4 180 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM75Q8N9X5 138 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LINC00477Q96M19 166 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DERL1Q9BUN8 251 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MED9Q9NWA0 146 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF492Q9P255 531 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSG8Q9UQ74 426 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FBN3Q75N90 2809 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDE6DO43924 150 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 INSP01308 110 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TSPOP30536 169 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDKN1BP46527 198 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF674Q2M3X9 581 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRR9Q5T870 116 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIR2DL5AQ8N109 375 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NHLRC2Q8NBF2 726 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C8orf49Q96NF6 230 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 B9D2Q9BPU9 175 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM208Q9BTX3 173 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGLV2-11P01706 119 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPX1P07203 203 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GFI1BQ5VTD9 330 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C2CD4CQ8TF44 421 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FMC1Q96HJ9 113 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLUHP3Q96NS8 147 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RCHY1Q96PM5 261 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TXNDC17Q9BRA2 123 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCEAL7Q9BRU2 100 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TREM1Q9NP99 234 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AMBPP02760 352 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPL35P42766 123 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PMS2P11Q13670 270 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C11orf52Q96A22 123 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TVP23CQ96ET8 276 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ODF3Q96PU9 254 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C7orf71A4D174 169 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAB19A4D1S5 217 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBE2CO00762 179 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RGS13O14921 159 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CRXO43186 299 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBMY1CP0DJD4 496 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HTN1P15515 57 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM183BQ1AE95 376 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPATA25Q9BR10 227 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NAGKQ9UJ70 344 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPRY2O43597 315 aa10.59□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PEA15Q15121 130 aa10.59□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CENPWQ5EE01 88 aa10.59□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 Q6ZQT7 251 aa10.59□□□□□ -0.71
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM19A4Q96LR4 140 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms