RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 SSX7Q7RTT5 188 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 TMED6Q8WW62 240 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 Q9H3A6 140 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.18□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.18□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.18□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.18□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 C3orf84H3BNL1 204 aa8.18□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 AMBPP02760 352 aa8.18□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.18□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.18□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 IL17DQ8TAD2 202 aa8.18□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00862A6NCI5 91 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP6V1G1O75348 118 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 CT45A10P0DMU9 189 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 CDKN1BP46527 198 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 CASC10Q5T4H9 136 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 SUN5Q8TC36 379 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 NEU1Q99519 415 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 CXorf1O96002 111 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 INSP01308 110 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 SEC11BP0C7V7 166 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 GCHFRP30047 84 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB14P61106 215 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 ERCC8Q13216 396 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 KIR3DS1Q14943 382 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 ODF3Q96PU9 254 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.16□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 PGPA6NDG6 321 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 FHITP49789 147 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 SULT1A2P50226 295 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00477Q96M19 166 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 VGLL1Q99990 258 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 OTORQ9NRC9 128 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 DIRC3C9JPN6 131 aa8.14□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 TSPOP30536 169 aa8.14□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 CSN1S1P47710 185 aa8.14□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.14□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.14□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 RBAKDNA6NC62 111 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 J3KRW8 73 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 HBE1P02100 147 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 PRM2P04554 102 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF492Q9P255 531 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 KLLNB2CW77 178 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 UMAD1C9J7I0 102 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 LEPP41159 167 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 PMS2P11Q13670 270 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 RRN3P1Q2M238 152 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 Q8TAT8 98 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 MED9Q9NWA0 146 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 CELA1Q9UNI1 258 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 GGTLC3B5MD39 225 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 PAX4O43316 350 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 CRISP2P16562 243 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF138P52744 262 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 GNG5P63218 68 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 COMMD7Q86VX2 200 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC01587Q99440 93 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL3L3-201ENST00000612839 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms