RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, human

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGMS1-208	ENST00000608287	ICAM4	Q14773	271 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SGMS1-208	ENST00000608287	FXYD5	Q96DB9	178 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SGMS1-208	ENST00000608287	FAM210B	Q96KR6	192 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SGMS1-208	ENST00000608287		J3KRW8	73 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	CT45A10	P0DMU9	189 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	HTN1	P15515	57 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	ZNF266	Q14584	549 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	KIR3DS1	Q14943	382 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	M6PR	P20645	277 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	LEP	P41159	167 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	TAS2R45	P59539	299 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	ERCC8	Q13216	396 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	RNF212	Q495C1	297 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	ZNF503	Q96F45	646 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	ODF3	Q96PU9	254 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287		A0A1W2PPV4	95 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	AZU1	P20160	251 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	TAS2R60	P59551	318 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	RAB2A	P61019	212 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287		H7BYZ3	331 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	DAD1	P61803	113 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	LINC00477	Q96M19	166 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	HTN3	P15516	51 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	C16orf74	Q96GX8	76 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SGMS1-208	ENST00000608287	LYRM9	A8MSI8	78 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	CSN1S1	P47710	185 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287		Q9H3A6	140 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	VGLL1	Q99990	258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	DEFB130B	P0DP73	79 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	DEFB130A	P0DP74	79 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	HERC1	Q15751	4861 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	C7orf71	A4D174	169 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287		G3V3Q6	166 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	GPX1	P07203	203 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	SERF2	P84101	59 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	HYLS1	Q96M11	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	KLLN	B2CW77	178 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	MB	P02144	154 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	CD300C	Q08708	224 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	BTN1A1	Q13410	526 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	OTOR	Q9NRC9	128 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	ZNF492	Q9P255	531 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	PGP	A6NDG6	321 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	SMLR1	H3BR10	107 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	ARPC5	O15511	151 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	CRISP2	P16562	243 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	ZNF138	P52744	262 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SGMS1-208	ENST00000608287		Q8TAT8	98 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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