RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CTRLP40313 264 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PMCHL1Q16048 86 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GLMPQ8WWB7 406 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ORM1P02763 201 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C16orf92Q96LL3 132 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FLNCQ14315 2725 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SVEP1Q4LDE5 3571 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 M0QZ24 198 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLV1-40P01703 118 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR5AL1P0C617 328 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF138P52744 262 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF580Q9UK33 172 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV12-3P01733 135 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLC6P0CF74 106 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF843Q8N446 348 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C2orf70A6NJV1 201 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC01559Q495D7 138 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLK15Q9H2R5 256 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM213A2RRL7 107 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A096LNT2 108 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LEPROTL1O95214 131 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV3-11P01762 117 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q6ZS46 218 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C2orf88Q9BSF0 95 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPG11Q96JI7 2443 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TWIST1Q15672 202 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPATA45Q537H7 98 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 U3KQK5 164 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SSTP61278 116 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFHR3Q02985 330 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TGFAP01135 160 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CSN3P07498 182 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ORMDL3Q8N138 153 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CNFNQ9BYD5 112 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A1L4Q6 167 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 M0R143 59 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FA2HQ7L5A8 372 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF575Q86XF7 245 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AMN1Q8IY45 258 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AP5S1Q9NUS5 200 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 D6R8Y8 96 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV4-59P01825 116 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF738Q8NE65 137 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRELID3AQ96N28 172 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.21□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.21□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C20orf202A1L168 122 aa14.21□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MUC21Q5SSG8 566 aa14.21□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP24Q9UPU5 2620 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OVOL1O14753 267 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC00477Q96M19 166 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM89A2RUT3 159 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CKS2P33552 79 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GPHB5Q86YW7 130 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATOH7Q8N100 152 aa14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms