RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576390.5

P4HB-223, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 4 BASIC

Gene P4HB, Length 439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-223	ENST00000576390	SMLR1	H3BR10	107 aa		13.19	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	HTN1	P15515	57 aa		13.19	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.18	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390		G3V3Q6	166 aa		13.18	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	SLC17A3	O00476	420 aa		13.18	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	IGLC2	P0DOY2	106 aa		13.18	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.18	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.18	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.17	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF266	Q14584	549 aa		13.17	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.17	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390		H3BTX0	84 aa		13.16	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	SSX7	Q7RTT5	188 aa		13.16	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		13.16	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF503	Q96F45	646 aa		13.16	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	C16orf90	A8MZG2	172 aa		13.15	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390		H3BQ15	152 aa		13.15	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	ARPC5	O15511	151 aa		13.15	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	CDK2AP2	O75956	126 aa		13.15	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		13.15	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.15	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	ODF3	Q96PU9	254 aa		13.15	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
P4HB-223	ENST00000576390		Q6ZNX1	250 aa		13.14	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		13.14	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390		Q9H8V8	135 aa		13.14	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		13.13	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		13.13	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	CT45A10	P0DMU9	189 aa		13.13	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	PYY	P10082	97 aa		13.13	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	HOXA5	P20719	270 aa		13.13	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		13.13	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	UPK3B	Q9BT76	320 aa		13.13	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		13.13	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		13.13	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.13	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		13.13	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390		H3BNG1	76 aa		13.12	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	M6PR	P20645	277 aa		13.12	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	OR5I1	Q13606	314 aa		13.12	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	GUK1	Q16774	197 aa		13.12	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.12	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.12	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	GAGE12B	A1L429	117 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF253	O75346	499 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	GAGE7	O76087	117 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	GAGE12F	P0CL80	117 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	GAGE12G	P0CL81	117 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	GAGE12I	P0CL82	117 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	LEP	P41159	167 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		13.11	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390		A0A0J9YY99	117 aa		13.1	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	SNURFL	B1AK76	121 aa		13.1	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	RAB2A	P61019	212 aa		13.1	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	ESRG	Q1W209	222 aa		13.1	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		13.1	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.1	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	OR51M1	Q9H341	326 aa		13.1	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390		Q9H3A6	140 aa		13.1	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		13.09	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390		J3KRW8	73 aa		13.09	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	OR7C2	O60412	319 aa		13.09	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	TTC32	Q5I0X7	151 aa		13.09	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		13.09	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.09	□□□□□ -0.31
P4HB-223	ENST00000576390	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390		A0A1W2PPQ1	181 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390		A0A1W2PPV4	95 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	OR10J4	P0C629	311 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	TAS2R45	P59539	299 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390		Q6ZTI0	123 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	C18orf15	Q96N68	181 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		13.08	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	HMSD	A8MTL9	139 aa		13.07	□□□□□ -0.32
P4HB-223	ENST00000576390	TAAR5	O14804	337 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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