RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 J3QRK9 145 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 SNAI2O43623 268 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 ELK1P19419 428 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 RAB4AP20338 218 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 DEFB1P60022 68 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 PRCDQ00LT1 54 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 MXD1Q05195 221 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 ST3GAL4Q11206 333 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 MSMO1Q15800 293 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 XAF1Q6GPH4 301 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.28□□□□□ -1.88
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TRIM25-208ENST00000574234 DEFB107AQ8IZN7 70 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 ZFP41Q8N8Y5 198 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 PECRQ9BY49 303 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 FKBP11Q9NYL4 201 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.28□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 COMMD9Q9P000 198 aa3.28□□□□□ -1.88
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TRIM25-208ENST00000574234 Q9UF83 564 aa3.28□□□□□ -1.88
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TRIM25-208ENST00000574234 A0A087WYN8 130 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 A0A0D9SG52 128 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 NDUFAF8A1L188 74 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 A6NDN8 102 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 ISLRO14498 428 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 RLN2P04090 185 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 RND2P52198 227 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 MS4A2Q01362 244 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 WFDC2Q14508 124 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.27□□□□□ -1.89
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TRIM25-208ENST00000574234 CANT1Q8WVQ1 401 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 GTSF1Q8WW33 167 aa3.27□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM203Q969S6 136 aa3.27□□□□□ -1.89
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TRIM25-208ENST00000574234 LINC00052Q96N35 136 aa3.27□□□□□ -1.89
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TRIM25-208ENST00000574234 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.27□□□□□ -1.89
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TRIM25-208ENST00000574234 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
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TRIM25-208ENST00000574234 LIMS4P0CW20 117 aa3.26□□□□□ -1.89
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TRIM25-208ENST00000574234 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.26□□□□□ -1.89
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TRIM25-208ENST00000574234 OR4X1Q8NH49 305 aa3.26□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 LINC01587Q99440 93 aa3.26□□□□□ -1.89
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TRIM25-208ENST00000574234 C9JCJ5 164 aa3.25□□□□□ -1.89
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TRIM25-208ENST00000574234 KIAA0087Q14695 138 aa3.25□□□□□ -1.89
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TRIM25-208ENST00000574234 H7BYZ3 331 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 SULT1C2O00338 296 aa3.24□□□□□ -1.89
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TRIM25-208ENST00000574234 HTN1P15515 57 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 DTYMKP23919 212 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 HRH1P35367 487 aa3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
TRIM25-208ENST00000574234 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
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