RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 C5orf17Q8NAS9 161 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 EDA2RQ9HAV5 297 aa24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 GGTLC3B5MD39 225 aa24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 INSP01308 110 aa24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPH3ALQ9UNE2 315 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 LEPP41159 167 aa24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 X6R8D5 127 aa24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2G2P60604 165 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf158Q8N1D5 194 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF492Q9P255 531 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MIFP14174 115 aa24■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GNG5P63218 68 aa23.99■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GV50 99 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF138P52744 262 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEU1Q99519 415 aa23.98■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0J9YWU9 116 aa23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCRAP04437 139 aa23.97■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM208Q9BTX3 173 aa23.97■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8NAQ8 132 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX46H3BTG2 121 aa23.95■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRISP2P16562 243 aa23.95■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR3DS1Q14943 382 aa23.95■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8TAT8 98 aa23.95■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 C20orf144Q9BQM9 153 aa23.95■■□□□ 1.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GFI1BQ5VTD9 330 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM256Q8N2U0 113 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 J3KRW8 73 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 K7EQM0 130 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 HBE1P02100 147 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPT1P50897 306 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATG101Q9BSB4 218 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 LENEPQ9Y5L5 61 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLLNB2CW77 178 aa23.93■■□□□ 1.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CST9LP1Q5W188 147 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAGE4O60829 102 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa23.91■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa23.9■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPX1P07203 203 aa23.9■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC28AQ8IWP9 274 aa23.9■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H2BAQ96A08 127 aa23.89■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCEAL7Q9BRU2 100 aa23.89■■□□□ 1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 C7orf71A4D174 169 aa23.89■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB4AO15263 64 aa23.89■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01587Q99440 93 aa23.89■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 H7BYZ3 331 aa23.88■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCL20P78556 96 aa23.88■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRN3P1Q2M238 152 aa23.88■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP5G3P48201 142 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM75Q8N9X5 138 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 MANBALQ9NQG1 85 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R60P59551 318 aa23.86■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTN1A1Q13410 526 aa23.86■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR9Q5T870 116 aa23.85■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 SGK494Q96LW2 274 aa23.85■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNG13Q9P2W3 67 aa23.85■■□□□ 1.41
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BLOC1S1P78537 153 aa23.84■■□□□ 1.41
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PSG8Q9UQ74 426 aa23.84■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa23.83■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUC7Q8TAX7 377 aa23.83■■□□□ 1.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMS2P11Q13670 270 aa23.82■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL17DQ8TAD2 202 aa23.82■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 TVP23CQ96ET8 276 aa23.82■■□□□ 1.4
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