RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 USMG5Q96IX5 58 aa6.84□□□□□ -1.31
PDPR-210ENST00000568530 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.84□□□□□ -1.31
PDPR-210ENST00000568530 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDPR-210ENST00000568530 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.84□□□□□ -1.31
PDPR-210ENST00000568530 CACNA1DQ01668 2161 aa6.84□□□□□ -1.31
PDPR-210ENST00000568530 NCR3O14931 201 aa6.84□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.84□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 EFNB3Q15768 340 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 MGST2Q99735 147 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 IGHV4-59P01825 116 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 F2Z2F3 143 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HIST1H2BKO60814 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 NDUFB1O75438 58 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HIST1H2BJP06899 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HIST1H2BOP23527 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HIST1H2BBP33778 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HIST1H2BDP58876 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HIST1H2BCP62807 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 A0A0J9YWU9 116 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 AMBPP02760 352 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 MTURNQ8N3F0 131 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 LIME1Q9H400 295 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 A0A1B0GW64 132 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 GLRX5Q86SX6 157 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 E7EQL1 145 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HLA-DRB4P13762 266 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 SLURP1P55000 103 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 MLANAQ16655 118 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 IGHV1-69P01742 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 TMEM258P61165 79 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 A0A087X0K7 114 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 C9JAW5 83 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 ZNF883P0CG24 379 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 DEFB135Q30KP9 77 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.82□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.324e-6■■■□□ 15.5
PDPR-210ENST00000568530 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 PROP1O75360 226 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 ACYP1P07311 99 aa6.81□□□□□ -1.32
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PDPR-210ENST00000568530 C5orf38Q86SI9 138 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 DYSFO75923 2080 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 NOTCH4Q99466 2003 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 UBE2D3P61077 147 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.81□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 IGKV1-16P04430 117 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.8□□□□□ -1.32
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PDPR-210ENST00000568530 X6R8D5 127 aa6.8□□□□□ -1.32
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PDPR-210ENST00000568530 Q6AWC8 147 aa6.8□□□□□ -1.32
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PDPR-210ENST00000568530 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 A0A087WWC5 75 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.8□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.79□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 UBL5Q9BZL1 73 aa6.79□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 A0A087WZ39 114 aa6.79□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.79□□□□□ -1.32
PDPR-210ENST00000568530 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.79□□□□□ -1.32
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