RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556356.1

LRP1-211, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRP1, Length 5,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-211ENST00000556356 NCR2O95944 276 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 ATOH7Q8N100 152 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 AJUBAQ96IF1 538 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 LY6G5BQ8NDX9 201 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 MED12LQ86YW9 2145 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 VCYO14598 125 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 NUP35Q8NFH5 326 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 ZNF492Q9P255 531 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.99□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 A0A087WWL8 130 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 D6R8Y8 96 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 NDUFA3O95167 84 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 SERF1AO75920 110 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 MYCNOSP40205 109 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 I3L2K1 104 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 PRR20EP86478 221 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 PRR20CP86479 221 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 PRR20DP86480 221 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 PRR20BP86481 221 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 PRR20AP86496 221 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 LAGE3Q14657 143 aa11.98□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 K7EIM0 57 aa11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 C8orf49Q96NF6 230 aa11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 IGLV2-23P01705 113 aa11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 LINC00518Q8N0U6 118 aa11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 PRR25Q96S07 402 aa11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 GFRA4Q9GZZ7 299 aa11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 GP9P14770 177 aa11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
LRP1-211ENST00000556356 AZU1P20160 251 aa11.96□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 CFHR3Q02985 330 aa11.96□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 ODF3BA8MYP8 253 aa11.96□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 PSCAO43653 123 aa11.96□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.96□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 DYSFO75923 2080 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 A0A087WW49 117 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 FXYD5Q96DB9 178 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 GAGE12BA1L429 117 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 A8MWV9 139 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 GGTLC3B5MD39 225 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 GAGE7O76087 117 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 GAGE12FP0CL80 117 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 GAGE12GP0CL81 117 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 GAGE12IP0CL82 117 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 IL15RAQ13261 267 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 NIT1Q86X76 327 aa11.95□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 MRAPQ8TCY5 172 aa11.94□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 CRYGCP07315 174 aa11.94□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 CSTL1Q9H114 145 aa11.94□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 LINC00574Q9H8X3 128 aa11.94□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa11.94□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 INAFM1C9JVW0 142 aa11.94□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 CTSGP08311 255 aa11.94□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.94□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 ZNF726P1Q15940 193 aa11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 MEGF9Q9H1U4 602 aa11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 DSCAMO60469 2012 aa11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 DOCK11Q5JSL3 2073 aa11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 TEX22C9J3V5 150 aa11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 VWC2Q2TAL6 325 aa11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 LINC01559Q495D7 138 aa11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 Q6YL49 198 aa11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 LINC00469Q8N7U9 141 aa11.93□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 DPM2O94777 84 aa11.92□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 SPXQ9BT56 116 aa11.92□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa11.92□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 CGB3P0DN86 165 aa11.92□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 CGB7P0DN87 165 aa11.92□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 C5orf30Q96GV9 206 aa11.92□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa11.92□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 FAM231BA6NCW3 169 aa11.92□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 CT83Q5H943 113 aa11.92□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 CYYR1Q96J86 154 aa11.92□□□□□ -0.5
LRP1-211ENST00000556356 PCNX3Q9H6A9 2034 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms