RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 FLVCR2Q9UPI3 526 aa4.78□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.78□□□□□ -1.64
GNPTAB-209ENST00000552009 NACAE9PAV3 2078 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 A0A0J9YY99 117 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 A8MTW9 85 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC17A3O00476 420 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 IL5P05113 134 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 METTL15P1P0C7V9 234 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CXCL3P19876 107 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 MEOX2P50222 304 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 DLK1P80370 383 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 BAK1Q16611 211 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 RNF212Q495C1 297 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM128Q5BJH2 165 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 PATE2Q6UY27 113 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 NRARPQ7Z6K4 114 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 ARL6Q9H0F7 186 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 HIGD1AQ9Y241 93 aa4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 PRAF2O60831 178 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 MED6O75586 246 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 OR5I1Q13606 314 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 LRTM2Q8N967 370 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 OR8A1Q8NGG7 326 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM210BQ96KR6 192 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 PSENENQ9NZ42 101 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CACFD1Q9UGQ2 172 aa4.76□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 C9orf170A2RU37 121 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 LYRM9A8MSI8 78 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CCSO14618 274 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 HYPMO75409 117 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 ATP5G1P05496 136 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 PRSS1P07477 247 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CFC1BP0CG36 223 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CFC1P0CG37 223 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 ATP5G3P48201 142 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 PSG3Q16557 428 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 SSX7Q7RTT5 188 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM144Q7Z5S9 345 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 C6orf223Q8N319 242 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 C15orf53Q8NAA6 179 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 LRRC20Q8TCA0 184 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 MARVELD1Q9BSK0 173 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 C7orf66A4D0T2 115 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 H3BQ15 152 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 PLA2G10O15496 165 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CFDP00746 253 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC25A6P12236 298 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 RPL7P18124 248 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 SAMD13Q5VXD3 122 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 WDR73Q6P4I2 378 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 LINC00305Q7Z4B0 112 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 ASB13Q8WXK3 278 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 GPR82Q96P67 336 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 MGST2Q99735 147 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 ARV1Q9H2C2 271 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 NUDT15Q9NV35 164 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 GSKIPQ9P0R6 139 aa4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 A0A087X0K7 114 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CBY3A6NI87 242 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 AGPAT2O15120 278 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 OR4E1P0C645 316 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 TSPOP30536 169 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 BTCP35070 178 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CDKN1BP46527 198 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CCL18P55774 89 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 TAS2R60P59551 318 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 CLINT1Q14677 625 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 OPCMLQ14982 345 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 ESRGQ1W209 222 aa4.73□□□□□ -1.65
GNPTAB-209ENST00000552009 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms