RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.85□□□□□ -0.99
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CS-230ENST00000551968 FAM25AB3EWG3 89 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-230ENST00000551968 FAM25CB3EWG5 89 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-230ENST00000551968 FAM25GB3EWG6 89 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-230ENST00000551968 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-230ENST00000551968 LAGE3Q14657 143 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-230ENST00000551968 OPCMLQ14982 345 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-230ENST00000551968 Q6ZRU5 148 aa8.84□□□□□ -0.99
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CS-230ENST00000551968 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.84□□□□□ -0.99
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CS-230ENST00000551968 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.83□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 RNF222A6NCQ9 220 aa8.83□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.83□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.83□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 EXTL2Q9UBQ6 330 aa8.83□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 SYNGR2O43760 224 aa8.82□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 GPX1P07203 203 aa8.82□□□□□ -1
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CS-230ENST00000551968 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
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CS-230ENST00000551968 SELENOTP62341 195 aa8.82□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 TDRG1Q3Y452 100 aa8.82□□□□□ -1
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CS-230ENST00000551968 RASL10AQ92737 203 aa8.82□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.82□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 DISC1C4P0D8 188 aa8.81□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 C4orf46Q504U0 113 aa8.81□□□□□ -1
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CS-230ENST00000551968 FUNDC2Q9BWH2 189 aa8.81□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 PANO1I0J062 215 aa8.8□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 K7EPK0 472 aa8.8□□□□□ -1
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CS-230ENST00000551968 PAXXQ9BUH6 204 aa8.8□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
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CS-230ENST00000551968 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.79□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 MED6O75586 246 aa8.79□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.79□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 Q8N976 141 aa8.79□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.79□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.78□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 NDUFB4O95168 129 aa8.78□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 VBP1P61758 197 aa8.78□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 CTF1Q16619 201 aa8.78□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.78□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.78□□□□□ -1
CS-230ENST00000551968 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
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CS-230ENST00000551968 AKAIN1P0CW23 69 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 SMIM18P0DKX4 95 aa8.77□□□□□ -1.01
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CS-230ENST00000551968 SRPXP78539 464 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 S100A7AQ86SG5 101 aa8.77□□□□□ -1.01
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CS-230ENST00000551968 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 PRRT1Q99946 306 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 AGPAT2O15120 278 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 Q8TAT8 98 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 MGST2Q99735 147 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 SOSTQ9BQB4 213 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 GOSR2O14653 212 aa8.75□□□□□ -1.01
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CS-230ENST00000551968 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 SRRQ9GZT4 340 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 PSENENQ9NZ42 101 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 ZNF492Q9P255 531 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 RNF24Q9Y225 148 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 ZNF253O75346 499 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 HOXB5P09067 269 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-230ENST00000551968 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
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