RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 TMEM189A5PLL7 270 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-224ENST00000551155 RBAKDNA6NC62 111 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-224ENST00000551155 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-224ENST00000551155 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-224ENST00000551155 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-224ENST00000551155 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-224ENST00000551155 Q8NAQ8 132 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-224ENST00000551155 X6R8D5 127 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-224ENST00000551155 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 DIRC3C9JPN6 131 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 HBE1P02100 147 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 NMBP08949 121 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 ZNF726P1Q15940 193 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 RRN3P1Q2M238 152 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 SLC51BQ86UW2 128 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 A0A1B0GVG6 124 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 A0A1W2PRE2 83 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 K7EQM0 130 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 CT45A10P0DMU9 189 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 RAB5CP51148 216 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 ZNF138P52744 262 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 ERCC8Q13216 396 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 TMED6Q8WW62 240 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 LINC01587Q99440 93 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 ZNF492Q9P255 531 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 TENM3Q9P273 2699 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 TEX46H3BTG2 121 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 H7BYZ3 331 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 DEFB4AO15263 64 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 GPX1P07203 203 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 CRISP2P16562 243 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 TAS2R60P59551 318 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 SSX7Q7RTT5 188 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 VGLL1Q99990 258 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 CXorf65A6NEN9 183 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 KLLNB2CW77 178 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 CD300CQ08708 224 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 CASC10Q5T4H9 136 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 EPDR1Q9UM22 224 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 C7orf71A4D174 169 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 NUPR2A6NF83 97 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 F6UZH7 168 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 J3KRW8 73 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 IFNA7P01567 189 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 TCRAP04437 139 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 HTN1P15515 57 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 FHITP49789 147 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 SULT1A2P50226 295 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 PPT1P50897 306 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 C16orf74Q96GX8 76 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 ATG101Q9BSB4 218 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 FAM74A7A6NL05 159 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 GGTLC3B5MD39 225 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-224ENST00000551155 C11orf94C9JXX5 98 aa6.72□□□□□ -1.33
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