RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 NUDT15Q9NV35 164 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 C7orf66A4D0T2 115 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 CBY3A6NI87 242 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM25EA8MYX2 175 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 E5RGE8 158 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 H3BNG1 76 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 K7EP13 123 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 AGPAT2O15120 278 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 ATP5G1P05496 136 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 METTL15P1P0C7V9 234 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 CXCL3P19876 107 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 C4BPBP20851 252 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 CSN1S1P47710 185 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 ATP5G3P48201 142 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 CCL18P55774 89 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 TAS2R45P59539 299 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 RHOBP62745 196 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 FGL1Q08830 312 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC38A11Q08AI6 406 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 ASAH1Q13510 395 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 PSG3Q16557 428 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 BAK1Q16611 211 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 VWC2Q2TAL6 325 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 OR8A1Q8NGG7 326 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00477Q96M19 166 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 ATG101Q9BSB4 218 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 NMES1Q9C002 83 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 ARL6Q9H0F7 186 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 BATF3Q9NR55 127 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRQ-204ENST00000549355 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SNURFLB1AK76 121 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 H3BP45 60 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 IFNA5P01569 189 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 C12orf74Q32Q52 190 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TTC32Q5I0X7 151 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TMED6Q8WW62 240 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC01587Q99440 93 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 APLNQ9ULZ1 77 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 LENEPQ9Y5L5 61 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A0A0MQY5 61 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A1W2PPQ1 181 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 K7EQM0 130 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 CIDEAO60543 219 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 UPK1BO75841 260 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 MBP02144 154 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 EMP1P54849 157 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 S100A10P60903 97 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF266Q14584 549 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 CLINT1Q14677 625 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM222AQ5U5X8 452 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 OR11H7Q8NGC8 314 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 C18orf15Q96N68 181 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 ATP5SQ99766 215 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms