RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 PRTN3P24158 256 aa7.32□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 HLA-DMBP28068 263 aa7.32□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 RAB37Q96AX2 223 aa7.32□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.32□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.32□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 BSNQ9UPA5 3926 aa7.32□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 TNFRSF6BO95407 300 aa7.32□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHG4P01861 327 aa7.32□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.32□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A1W2PPM0 123 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 OOSP1A8MZH6 123 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 SAP30O75446 220 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 PRSS1P07477 247 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 FABP2P12104 132 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 RAB9AP51151 201 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 ERCC8Q13216 396 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 ODF1Q14990 250 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 CSTL1Q9H114 145 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 ZMAT4Q9H898 229 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 RBAKDNA6NC62 111 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 LY6HO94772 140 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKCP01834 107 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 SMIM13P0DJ93 91 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM11P17152 192 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 EVI2AP22794 236 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF575Q86XF7 245 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 Q8N6K4 173 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 HIGD1BQ9P298 99 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 SMPXQ9UHP9 88 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP5LO75964 103 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 GCSHP23434 173 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 DPM2O94777 84 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 GAS8-AS1O95177 125 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 TM4SF20Q53R12 229 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 Q8N8P6 123 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 FOXC2Q99958 501 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 AKAP13Q12802 2813 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 PRAC2D3DTV9 90 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 DTX2Q86UW9 622 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 ATMQ13315 3056 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 G3V4G9 280 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 GOSR1O95249 250 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 EBI3Q14213 229 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 C15orf32Q32M92 178 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 RNF182Q8N6D2 247 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 TACC2O95359 2948 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 BUB3O43684 328 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 HLA-DRB4P13762 266 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 FXYD2P54710 66 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 SMIM17P0DL12 118 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 RIPPLY3P57055 190 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 ECSCRQ19T08 205 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 APC2O95996 2303 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 CLEC3BP05452 202 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 LAGE3Q14657 143 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 Q8N9W7 124 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.27□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM160Q9NX00 188 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms