RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 OR52I2Q8NH67 350 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 LINC00477Q96M19 166 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 GPR132Q9UNW8 380 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 WRBO00258 174 aa6.59□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.59□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.59□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.59□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 NRG4Q8WWG1 115 aa6.59□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 RASL10AQ92737 203 aa6.59□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 RMI2Q96E14 147 aa6.59□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.58□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 A0A0D9SG52 128 aa6.58□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 FABP12A6NFH5 140 aa6.58□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 GGTLC3B5MD39 225 aa6.58□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 DISC1C4P0D8 188 aa6.58□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 PITX3O75364 302 aa6.58□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.58□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.58□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 FAM25AB3EWG3 89 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 FAM25CB3EWG5 89 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 FAM25GB3EWG6 89 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 SYNGR2O43760 224 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 HPGDSO60760 199 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 CRISP2P16562 243 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 ODF1Q14990 250 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 SPXQ9BT56 116 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 H3BP45 60 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 H3BQ15 152 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 NMBP08949 121 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 IGLC2P0DOY2 106 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 ANXA3P12429 323 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 SRPXP78539 464 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 GUK1Q16774 197 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 Q6ZQT7 251 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 Q8N3U1 123 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 SRRQ9GZT4 340 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 M0R3E3 92 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 GOSR2O14653 212 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 COX7A2P2O60397 106 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 NEDD8Q15843 81 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 VWC2Q2TAL6 325 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 C14orf177Q52M58 125 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 PRR9Q5T870 116 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 YIPF6Q96EC8 236 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 LINC01600Q96MT4 127 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 VCX3BQ9H321 246 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.55□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 K7EPK0 472 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 SLC25A6P12236 298 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 MUC21Q5SSG8 566 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 PRRT1Q99946 306 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 PRELID1Q9Y255 219 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.54□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.53□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 A0A0U1RQV1 116 aa6.53□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF253O75346 499 aa6.53□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 AKAIN1P0CW23 69 aa6.53□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.53□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF546Q86UE3 836 aa6.53□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.53□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.53□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.53□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 RAB26Q9ULW5 256 aa6.53□□□□□ -1.36
KDM5A-211ENST00000544777 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
KDM5A-211ENST00000544777 M0R2P5 195 aa6.52□□□□□ -1.37
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