RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	LEP	P41159	167 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	SULT1A1	P50225	295 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	GUK1	Q16774	197 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	MIC13	Q5XKP0	118 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	ESRG	Q1W209	222 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	TTC32	Q5I0X7	151 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	ODF3	Q96PU9	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	UPK3B	Q9BT76	320 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777		H3BNG1	76 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZTI0	123 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	PFDN5	Q99471	154 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777		Q9H3A6	140 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	HSPB11	Q9Y547	144 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF253	O75346	499 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	VWC2	Q2TAL6	325 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	STX12	Q86Y82	276 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	WFDC1	Q9HC57	220 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	PET100	P0DJ07	73 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	BAX	Q07812	192 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	ERCC8	Q13216	396 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	THAP6	Q8TBB0	222 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	C7orf71	A4D174	169 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777		M0R3E3	92 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	S100A11	P31949	105 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	CD300C	Q08708	224 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00477	Q96M19	166 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	FGF7	P21781	194 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	ASB13	Q8WXK3	278 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777		A0A096LPF7	62 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	KLLN	B2CW77	178 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	NDUFB4	O95168	129 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP10-2	P60368	255 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	HBG1	P69891	147 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	HBG2	P69892	147 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777		Q8N1X5	172 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	C18orf15	Q96N68	181 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	AQP10	Q96PS8	301 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	FUT9	Q9Y231	359 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	PYY	P10082	97 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	PDE6H	Q13956	83 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	ATP6V1F	Q16864	119 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	BLNK	Q8WV28	456 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	ATP5S	Q99766	215 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	MPDU1	O75352	247 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	GPX1	P07203	203 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	ARPC5	O15511	151 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDX11-222	ENST00000542777	SPINK4	O60575	86 aa		11.03	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms