RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534645.1

RCE1-208, Transcript of Ras converting CAAX endopeptidase 1, human

TSL 5

Gene RCE1, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCE1-208	ENST00000534645	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	IGLL5	B9A064	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	GCHFR	P30047	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	LEP	P41159	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	CDKN1B	P46527	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	SULT1A2	P50226	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	RAB5C	P51148	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1-208	ENST00000534645	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645		A0A1B0GV50	99 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645		H7BYZ3	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645		M0R3E3	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	NDUFB4	O95168	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	CXorf1	O96002	111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	HTN3	P15516	51 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	TAS2R60	P59551	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	DAD1	P61803	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	LINC01587	Q99440	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645		J3KRW8	73 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	HTN1	P15515	57 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	ICAM4	Q14773	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	C7orf71	A4D174	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	IFNA7	P01567	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	CSN1S1	P47710	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	UBE2G2	P60604	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	CCL20	P78556	96 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	ERCC8	Q13216	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645		Q9H3A6	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	PGP	A6NDG6	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCE1-208	ENST00000534645	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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