RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		7.94	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	NDUFB4	O95168	129 aa		7.94	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	IGLV2-8	P01709	118 aa		7.94	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	OR4E1	P0C645	316 aa		7.94	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	CRISP2	P16562	243 aa		7.94	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	ASIP	P42127	132 aa		7.94	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	ID3	Q02535	119 aa		7.94	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		7.94	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		7.94	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		7.94	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		7.93	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	HOXB5	P09067	269 aa		7.93	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	SRPX	P78539	464 aa		7.93	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	ODF1	Q14990	250 aa		7.93	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	CTF1	Q16619	201 aa		7.93	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		7.93	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557		Q9H521	79 aa		7.93	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		7.93	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	RGS13	O14921	159 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	AGPAT2	O15120	278 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6V1G2	O95670	118 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	ORM1	P02763	201 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	GPX1	P07203	203 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	ANXA3	P12429	323 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	TIRAP	P58753	221 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	BAALC	Q8WXS3	180 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	RASL10A	Q92737	203 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00477	Q96M19	166 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	MGST2	Q99735	147 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		7.92	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		7.91	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	CTDSPL	O15194	276 aa		7.91	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	MUC21	Q5SSG8	566 aa		7.91	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		7.91	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		7.91	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	MCUB	Q9NWR8	336 aa		7.91	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		7.91	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	GOSR2	O14653	212 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	COX7A2P2	O60397	106 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	VAMP1	P23763	118 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R1A	Q13522	171 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF846	Q147U1	533 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	AP3S1	Q92572	193 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		7.9	□□□□□ -1.14
BBS1-222	ENST00000533557		C9JCJ5	164 aa		7.89	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	SFT2D2	O95562	160 aa		7.89	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	SMIM8	Q96KF7	97 aa		7.89	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		7.89	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	SOST	Q9BQB4	213 aa		7.89	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557		A0A087WXM4	84 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	RNF222	A6NCQ9	220 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	FNDC10	F2Z333	226 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	RS1	O15537	224 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	RGS5	O15539	181 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	SSSCA1	O60232	199 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	NMB	P08949	121 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	TNFSF8	P32971	234 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	PPT1	P50897	306 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	IL18	Q14116	193 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	GUK1	Q16774	197 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	MIC13	Q5XKP0	118 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	S100A7A	Q86SG5	101 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF546	Q86UE3	836 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557		Q8TAT8	98 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	TM2D2	Q9BX73	214 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF492	Q9P255	531 aa		7.88	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		7.87	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		7.87	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF253	O75346	499 aa		7.87	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	PYY	P10082	97 aa		7.87	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	RNF24	Q9Y225	148 aa		7.87	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		7.86	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	GNRH2	O43555	120 aa		7.86	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	LAGE3	Q14657	143 aa		7.86	□□□□□ -1.15
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		7.86	□□□□□ -1.15

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