RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533039.2

SOX9-AS1-210, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene SOX9-AS1, Length 426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00477Q96M19 166 aa6.14□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.14□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.14□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NDUFB4O95168 129 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GPX1P07203 203 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PET100P0DJ07 73 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 M6PRP20645 277 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DEFA1P59665 94 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DEFA3P59666 94 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ERCC8Q13216 396 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ICAM4Q14773 271 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RNF141Q8WVD5 230 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR51M1Q9H341 326 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.13□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KLLNB2CW77 178 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 H3BNG1 76 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SSNA1O43805 119 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NMBP08949 121 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KMT2AQ03164 3969 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SSX7Q7RTT5 188 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF503Q96F45 646 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PAXXQ9BUH6 204 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.12□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A0A0J9YY99 117 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A6NHS1 94 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RGS13O14921 159 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR7C2O60412 319 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IFNA5P01569 189 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR10J4P0C629 311 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MED14OSP0DP75 135 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CRISP2P16562 243 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CSN1S1P47710 185 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 H2BFSP57053 126 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IFITM3Q01628 133 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CD300CQ08708 224 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 BTN1A1Q13410 526 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q6ZTI0 123 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ATP5SQ99766 215 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF492Q9P255 531 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FUT9Q9Y231 359 aa6.11□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 H0YIZ8 118 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MPC2O95563 127 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HOXA5P20719 270 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF138P52744 262 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TCL1AP56279 114 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TAS2R45P59539 299 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KHDC3LQ587J8 217 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TTC32Q5I0X7 151 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C6orf223Q8N319 242 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FXYD5Q96DB9 178 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q9H8V8 135 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HSPB11Q9Y547 144 aa6.1□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RBAKDNA6NC62 111 aa6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RANP62826 216 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C18orf15Q96N68 181 aa6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 VGLL1Q99990 258 aa6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms