RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528494.5

ATG13-211, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG13, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-211ENST00000528494 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.04□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 A0A1W2PPM0 123 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 GATA3P23771 443 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 PIFOQ8TCI5 191 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 MRAP2Q96G30 205 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 LINC01548A6NM66 108 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 J3QR89 54 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 S4R3C0 116 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 H3BUX3 64 aa10.02□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 KIR3DS1Q14943 382 aa10.02□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 LINC00173Q6ZV60 143 aa10.02□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 FA2HQ7L5A8 372 aa10.02□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 MBD6Q96DN6 1003 aa10.02□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa10.02□□□□□ -0.8
ATG13-211ENST00000528494 SNAI2O43623 268 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 OR2J3O76001 311 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 ASPHD1Q5U4P2 390 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 SPATA25Q9BR10 227 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 FABP2P12104 132 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 FOXE3Q13461 319 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 FNDC10F2Z333 226 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 ECSCRQ19T08 205 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 GDF5OSQ5U4N7 250 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 BLNKQ8WV28 456 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 RAB37Q96AX2 223 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 ACANP16112 2415 aa10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 SONP18583 2426 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 CA1P00915 261 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 LINC00527Q9UJ94 153 aa10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 ATP6V0E1O15342 81 aa10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 OR5AL1P0C617 328 aa10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 PRR20EP86478 221 aa10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 PRR20CP86479 221 aa10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 PRR20DP86480 221 aa10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 PRR20BP86481 221 aa10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 PRR20AP86496 221 aa10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 C5orf56Q8N8D9 126 aa10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 CR1P17927 2039 aa10□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 G3V318 75 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 H0Y8G0 127 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 I3L2K1 104 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 RABAC1Q9UI14 185 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 AKAP9Q99996 3911 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 A0A1W2PRE2 83 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 J3QLI3 93 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 IGLV2-8P01709 118 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 IGHV3-23P01764 117 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 CRYGCP07315 174 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 NUP35Q8NFH5 326 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 K7EIM0 57 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 TSPAN13O95857 204 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 CAMPP49913 170 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 ZNF479Q96JC4 524 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 IGHV4-59P01825 116 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 BLCAPP62952 87 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 LINC01545Q5VT33 79 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 IL17RELQ6ZVW7 336 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.96□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.96□□□□□ -0.81
ATG13-211ENST00000528494 OR11H12B2RN74 326 aa9.96□□□□□ -0.82
ATG13-211ENST00000528494 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
ATG13-211ENST00000528494 ORM2P19652 201 aa9.96□□□□□ -0.82
ATG13-211ENST00000528494 Q6ZS46 218 aa9.96□□□□□ -0.82
ATG13-211ENST00000528494 THAP8Q8NA92 274 aa9.96□□□□□ -0.82
ATG13-211ENST00000528494 OR11H1Q8NG94 326 aa9.96□□□□□ -0.82
ATG13-211ENST00000528494 OR11H2Q8NH07 326 aa9.96□□□□□ -0.82
ATG13-211ENST00000528494 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.95□□□□□ -0.82
ATG13-211ENST00000528494 A6NDX4 124 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms