RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 IGLL5B9A064 214 aa2.99□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa2.99□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 PITX3O75364 302 aa2.99□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 HYPMO75409 117 aa2.99□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 IL5P05113 134 aa2.99□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 NMBP08949 121 aa2.99□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 PTHLHP12272 177 aa2.99□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 STX12Q86Y82 276 aa2.99□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 HIGD1AQ9Y241 93 aa2.99□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 H7BYZ3 331 aa2.98□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 HLA-DMBP28068 263 aa2.98□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 CDKN1BP46527 198 aa2.98□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 DAD1P61803 113 aa2.98□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 BAXQ07812 192 aa2.98□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 CD300CQ08708 224 aa2.98□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 TIGITQ495A1 244 aa2.98□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa2.98□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 C18orf15Q96N68 181 aa2.98□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 SOSTQ9BQB4 213 aa2.98□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC32Q9BV29 185 aa2.98□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 RBKSQ9H477 322 aa2.98□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 SLC39A9Q9NUM3 307 aa2.98□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa2.97□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa2.97□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa2.97□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 C17orf112F2Z3M2 114 aa2.97□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 H3BMQ9 156 aa2.97□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 H3BRN7 92 aa2.97□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 H7C423 109 aa2.97□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 FAM74A1Q5RGS3 127 aa2.97□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 VGLL1Q99990 258 aa2.97□□□□□ -1.93
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HDAC2-216ENST00000523628 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa2.97□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A31Q9H0C2 315 aa2.97□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 APLNQ9ULZ1 77 aa2.97□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 LENEPQ9Y5L5 61 aa2.97□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 C9orf170A2RU37 121 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 RBAKDNA6NC62 111 aa2.96□□□□□ -1.94
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