RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511313.5

POLR2J3-215, Transcript of RNA polymerase II subunit J3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLR2J3, Length 4,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3-215ENST00000511313 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR2J3-215ENST00000511313 CFHR3Q02985 330 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR2J3-215ENST00000511313 BAGE3Q86Y29 109 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR2J3-215ENST00000511313 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR2J3-215ENST00000511313 F8W735 103 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
POLR2J3-215ENST00000511313 CCL20P78556 96 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR2J3-215ENST00000511313 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A096LNT2 108 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR2J3-215ENST00000511313 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
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POLR2J3-215ENST00000511313 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.39□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.39□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 MGST2Q99735 147 aa7.39□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 DEFB135Q30KP9 77 aa7.38□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 M0R381 172 aa7.38□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.38□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.38□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 SZT2Q5T011 3432 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.37□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 IGLL5B9A064 214 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 PAX9P55771 341 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 DEFB125Q8N687 156 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 GAGE12BA1L429 117 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 GAGE7O76087 117 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 GAGE12FP0CL80 117 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 GAGE12GP0CL81 117 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 GAGE12IP0CL82 117 aa7.36□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 TMEM213A2RRL7 107 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 NMUP48645 174 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 RNF126Q9BV68 326 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF492Q9P255 531 aa7.36□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 VCYO14598 125 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 HSBP1O75506 76 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.35□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 NDUFB4O95168 129 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 MUC21Q5SSG8 566 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 CXCL3P19876 107 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF876PQ49A33 203 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 CLLU1Q5K131 121 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.34□□□□□ -1.23
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