RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 CD300CQ08708 224 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf74Q96GX8 76 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3BGRL3Q9H299 93 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 Q9H3A6 140 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 BIRC6Q9NR09 4857 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 KLLNB2CW77 178 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB130BP0DP73 79 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB130AP0DP74 79 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 M6PRP20645 277 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 RANP62826 216 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6ZQT7 251 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2T35Q8NGX2 323 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.23□□□□□ -0.29
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SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V0CP27449 155 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF266Q14584 549 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.22□□□□□ -0.29
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SH3BP2-218ENST00000511185 C7orf71A4D174 169 aa13.21□□□□□ -0.29
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SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R45P59539 299 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ASB13Q8WXK3 278 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
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SH3BP2-218ENST00000511185 OR10G7Q8NGN6 311 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2G3Q8NGZ4 309 aa13.2□□□□□ -0.3
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SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM78Q5T7P6 136 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00477Q96M19 166 aa13.19□□□□□ -0.3
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF492Q9P255 531 aa13.19□□□□□ -0.3
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SH3BP2-218ENST00000511185 HYLS1Q96M11 299 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 DIRC3C9JPN6 131 aa13.17□□□□□ -0.3
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SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
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SH3BP2-218ENST00000511185 STAG3L3P0CL85 134 aa13.16□□□□□ -0.3
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SH3BP2-218ENST00000511185 CSN1S1P47710 185 aa13.15□□□□□ -0.3
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SH3BP2-218ENST00000511185 F5H768 121 aa13.14□□□□□ -0.31
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SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC28AQ8IWP9 274 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GAGE12BA1L429 117 aa13.13□□□□□ -0.31
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SH3BP2-218ENST00000511185 GAGE7O76087 117 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP5G1P05496 136 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GAGE12FP0CL80 117 aa13.13□□□□□ -0.31
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SH3BP2-218ENST00000511185 GAGE12IP0CL82 117 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 P0DMU3 169 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM231AP0DMU4 169 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM231CP0DMU5 169 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 GCHFRP30047 84 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP5G3P48201 142 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF726P1Q15940 193 aa13.13□□□□□ -0.31
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SH3BP2-218ENST00000511185 FAM210BQ96KR6 192 aa13.13□□□□□ -0.31
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SH3BP2-218ENST00000511185 NMBP08949 121 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00467Q9BRT7 94 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 F6UZH7 168 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXA5P20719 270 aa13.11□□□□□ -0.31
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