RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 A6NDX4 124 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 RNF223E7ERA6 249 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZS46 218 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHG2P01859 326 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00614P0C842 121 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-208ENST00000510829 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 FA2HQ7L5A8 372 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV4-59P01825 116 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 USMG5Q96IX5 58 aa8.5□□□□□ -1.05
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RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1B0GW15 77 aa8.5□□□□□ -1.05
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RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 LEPROTL1O95214 131 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 BATFQ16520 125 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHG4P01861 327 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 IGF1P05019 195 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 SPATA45Q537H7 98 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF843Q8N446 348 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 AMN1Q8IY45 258 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A087X0K7 114 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFA4O00483 81 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 CKS2P33552 79 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 C20orf202A1L168 122 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 D6R8Y8 96 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 SRD5A1P18405 259 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 PRELID3AQ96N28 172 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 TM4SF20Q53R12 229 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1B0GV90 55 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 M0R143 59 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 OR5AL1P0C617 328 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 ORMDL3Q8N138 153 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 SMKR1H3BMG3 65 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 H3BUA1 57 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 KLK9Q2XQG4 91 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 GLMPQ8WWB7 406 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP6V0BQ99437 205 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.45□□□□□ -1.06
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RABGEF1-208ENST00000510829 NCR2O95944 276 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 TFPI2P48307 235 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP10-9P60411 292 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.45□□□□□ -1.06
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RABGEF1-208ENST00000510829 RAB4AP20338 218 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB1P60022 68 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 U3KQE9 123 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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